168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7624 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 169 aa  333  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5187  NUDIX hydrolase  50.62 
 
 		 171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.466723  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  36 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  36 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  35.2 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  42.71 
 
 		 151 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  35.2 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1991  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.85 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0533  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0228598  normal  0.521082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0346  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0239643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2376  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  38.18 
 
 		 120 aa  52  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 197 aa  51.6  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 291 aa  51.2  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 134 aa  51.2  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  38.18 
 
 		 120 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0990  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000363849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  30.17 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  35.45 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1569  hypothetical protein  31.58 
 
 		 165 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 130 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 133 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  32 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  32 
 
 		 141 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  31.2 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 101 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 		 130 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  30.4 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  33.91 
 
 		 314 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2733  NADH pyrophosphatase  31.3 
 
 		 269 aa  47.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  31.2 
 
 		 141 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 130 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0969  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  34.82 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0417204 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  30.63 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.85 
 
 		 133 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  33.04 
 
 		 314 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4600  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0447936 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  45.61 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  32.52 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1708  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  26.9 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.68 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1582  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  35.94 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.196336  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5561  hypothetical protein  38.89 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 134 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 291 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  39.39 
 
 		 314 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  38.89 
 
 		 178 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  33.04 
 
 		 314 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  33.04 
 
 		 314 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  27.64 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  42.86 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  26.9 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0604  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0396  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000159718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  41.25 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  30.63 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20640  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase, type 1  28.18 
 
 		 213 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1553  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  39.39 
 
 		 313 aa  44.7  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  39.39 
 
 		 315 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  36.21 
 
 		 136 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  39.39 
 
 		 315 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  28.47 
 
 		 524 aa  44.3  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 134 aa  44.3  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4458  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  43.64 
 
 		 320 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>