More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3691 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 		 141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  38.33 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  38.02 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 130 aa  94  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 130 aa  94  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  36.29 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  36.29 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  38.84 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  34.68 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  35.59 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  36.29 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  34.17 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 347 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  35.25 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  35.2 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  34.35 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  30.83 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  31.97 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  31.58 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  33.88 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  30.83 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  31.34 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  35.77 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0100  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  33.06 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  33.58 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.09 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  33.59 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  33.59 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  29.32 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.8 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  35.19 
 
 		 570 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  33.06 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  34.51 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  30.65 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  31.3 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  32.82 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.23 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  33.09 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.23 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.23 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>