More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3270 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 139 aa  287  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  94.81 
 
 		 147 aa  239  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  69.05 
 
 		 154 aa  189  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  61.79 
 
 		 138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  56 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  56.67 
 
 		 133 aa  158  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 		 138 aa  120  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 		 141 aa  113  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  42.74 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  39.5 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  44.44 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 137 aa  97.1  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  38.21 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  38.21 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 129 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  43.22 
 
 		 138 aa  90.1  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  38.1 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  38.93 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  38.93 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  38.79 
 
 		 129 aa  87.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 132 aa  87  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.02 
 
 		 360 aa  87  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  42.74 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  35.54 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  38.52 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  39.2 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  32.85 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  38.17 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  40.32 
 
 		 144 aa  84.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  40.34 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  31.5 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  39.83 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  34.62 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  42.16 
 
 		 352 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40.34 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  42.48 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  38.98 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  39.39 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  37.19 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  39.02 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.43 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  42.72 
 
 		 386 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  38.38 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  41.18 
 
 		 352 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  37.07 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  33.07 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  42.73 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  42.73 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  35.25 
 
 		 314 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  36.07 
 
 		 314 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.71 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.28 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  38.14 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  38.14 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.8 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.8 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.56 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  34.43 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.8 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.8 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.56 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  35.43 
 
 		 318 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.56 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>