More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3770 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  92.19 
 
 		 128 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  54.84 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 128 aa  122  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  53.28 
 
 		 145 aa  121  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  51.54 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  51.91 
 
 		 291 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  51.54 
 
 		 153 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 		 267 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 169 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  56.35 
 
 		 133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  53.72 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  50.81 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 		 144 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  48 
 
 		 141 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 		 132 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 		 132 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 		 132 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 		 134 aa  98.2  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 206 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  42.31 
 
 		 145 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 153 aa  92.4  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 148 aa  92  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  51.4 
 
 		 570 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  38.14 
 
 		 132 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  49.23 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 156 aa  88.6  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 130 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 166 aa  87  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 130 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 		 132 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 132 aa  85.1  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.73 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  41.79 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.73 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.73 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  38.58 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.73 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  37.4 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  41.73 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.73 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 		 139 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 151 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 128 aa  80.9  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.21 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  35.66 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.94 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  35.66 
 
 		 352 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  40.41 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  36.22 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  37.8 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 137 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 146 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.16 
 
 		 360 aa  75.1  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  38.84 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 129 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  42.4 
 
 		 131 aa  74.7  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 138 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 138 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  34.56 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  35.54 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  35.54 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.54 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.72 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.54 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.54 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 129 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 129 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 143 aa  72  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 129 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 138 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 		 138 aa  72  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  36.51 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.51 
 
 		 137 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  33.59 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  37.98 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  33.59 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  37.17 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  38.66 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  40.32 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>