More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4152 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  100 
 
 
128 aa  253  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  92.19 
 
 
200 aa  234  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 
128 aa  120  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  51.64 
 
 
145 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  52.85 
 
 
130 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  49.24 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  51.18 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 
291 aa  114  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 
267 aa  112  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 
169 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  54.69 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  53.72 
 
 
132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  50.41 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 
144 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  47.58 
 
 
141 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  44.63 
 
 
132 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  44.63 
 
 
132 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 
132 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
206 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 
134 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  41.41 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
244 aa  89.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
156 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  35.94 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  48.6 
 
 
570 aa  88.2  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
130 aa  84.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
130 aa  84.3  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
147 aa  84  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
135 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.16 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  39.84 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  38.76 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  36.72 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  36.59 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  35.77 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.4 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  35.77 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  37.1 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  37.9 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  42.28 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.59 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.59 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.22 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.59 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  41.98 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.07 
 
 
360 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  35.54 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  35.54 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.59 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.59 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  36.84 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.54 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  34.68 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.54 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.54 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  38.02 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  34.68 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.68 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  32.56 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  32.56 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  37.19 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  33.87 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  31.75 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  40.31 
 
 
319 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  33.85 
 
 
400 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.9 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>