More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0755 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  100 
 
 
267 aa  491  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  60.8 
 
 
133 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  55.47 
 
 
291 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 
128 aa  116  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 
128 aa  112  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 
200 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
130 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  49.6 
 
 
148 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  52.85 
 
 
145 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
132 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  50.39 
 
 
570 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
132 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
132 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  48.8 
 
 
141 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  48 
 
 
206 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
144 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  47.69 
 
 
147 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  42.21 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
124 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 
169 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 
132 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  34.68 
 
 
132 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
130 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
130 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 
153 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
167 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 
132 aa  85.5  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
132 aa  79  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.4 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.4 
 
 
135 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
135 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  38.21 
 
 
145 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.4 
 
 
135 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  37.4 
 
 
135 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.4 
 
 
135 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  37.7 
 
 
131 aa  73.9  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  34.4 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.77 
 
 
135 aa  72  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
138 aa  72  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.48 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
147 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.48 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.48 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 
133 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
138 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 
151 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  36.8 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  36 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.4 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.4 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  36.8 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  36.8 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.4 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  40.71 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  36 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
166 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  30.58 
 
 
137 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  31.97 
 
 
321 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  35 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.96 
 
 
135 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.59 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.59 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  39.23 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  36 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  39.02 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  32.79 
 
 
139 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  34.4 
 
 
142 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
147 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
129 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  36.43 
 
 
132 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  31.65 
 
 
141 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  38.46 
 
 
329 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  38.46 
 
 
329 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
147 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
143 aa  62.8  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  34.4 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  29.55 
 
 
399 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
142 aa  63.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.48 
 
 
140 aa  62.4  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.81 
 
 
135 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  29.6 
 
 
134 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.53 
 
 
360 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
129 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.69 
 
 
132 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 
153 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  29.92 
 
 
132 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>