More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3838 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  100 
 
 
144 aa  276  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  59.18 
 
 
147 aa  158  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  56.15 
 
 
128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  55.12 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  54.48 
 
 
130 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 
132 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 
200 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 
128 aa  107  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  54.92 
 
 
124 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  46.04 
 
 
570 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  47.59 
 
 
145 aa  101  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
267 aa  100  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  50.4 
 
 
291 aa  99.4  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  47.79 
 
 
133 aa  96.7  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
169 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  45 
 
 
167 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  39.73 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  48.2 
 
 
147 aa  94.4  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
132 aa  94  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  51.3 
 
 
166 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  52.68 
 
 
151 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  33.6 
 
 
132 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
130 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  43.61 
 
 
141 aa  87  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  39.53 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  49.57 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  37.8 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  37.8 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  36.92 
 
 
139 aa  84  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  40.15 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  40.15 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
206 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  39.39 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  39.39 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.39 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  40.58 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  38.64 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.27 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.48 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  40 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
139 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.48 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  45.86 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  39.53 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  39.53 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  43.75 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
133 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
135 aa  77  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.07 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  37.88 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.02 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.02 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  36.36 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  42.74 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.02 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  40.16 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.76 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  39.01 
 
 
316 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  42.4 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  42.4 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  37.8 
 
 
128 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  38.41 
 
 
347 aa  74.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  41.13 
 
 
136 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.66 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  37.4 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>