More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1031 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  100 
 
 		 131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  100 
 
 		 131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  57.81 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  53.44 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  50 
 
 		 132 aa  133  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  39.52 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  41.54 
 
 		 134 aa  92.8  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.86 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  33.08 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  33.6 
 
 		 318 aa  80.1  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  37.4 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  36.89 
 
 		 570 aa  77.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.59 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  36.22 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  37.4 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.81 
 
 		 131 aa  76.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  36.22 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  31.5 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  34.17 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  36 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  33.08 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  35.04 
 
 		 302 aa  73.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0100  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  33.08 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  31.82 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  32.81 
 
 		 319 aa  72  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  33.08 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.89 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  36.07 
 
 		 363 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.38 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  33.08 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  32.31 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.86 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.5 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  33.86 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.86 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.86 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  31.78 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  33.61 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  31.78 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  32.81 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.92 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  36.89 
 
 		 329 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  30.53 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  36.89 
 
 		 329 aa  70.5  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  36.89 
 
 		 352 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  34.65 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  34.65 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.86 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  34.65 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 334 aa  70.1  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.15 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.15 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.47 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  28.46 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>