More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2684 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
134 aa  278  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  53.08 
 
 
133 aa  148  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
132 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
136 aa  100  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
130 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
130 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  41.09 
 
 
132 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
154 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  37.12 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  41.54 
 
 
131 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  41.54 
 
 
131 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
141 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
131 aa  89.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  36.22 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  33.59 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.11 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.11 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  34.88 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  36.15 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  34.09 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  30.88 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  29.13 
 
 
129 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  33.33 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.23 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.78 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.78 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  29.85 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  32.81 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.32 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
153 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.11 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  32 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.11 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.57 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.46 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  29.46 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  29.46 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  29.46 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.46 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.91 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.12 
 
 
131 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
316 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
129 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  27.27 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  32.59 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  33.58 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.46 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  27.34 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  33.58 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  28.12 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  32.56 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  31.85 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  33.58 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.56 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  32.35 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  33.58 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
128 aa  64.7  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  31.34 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  26.15 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  33.33 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  32.85 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.78 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  35.43 
 
 
352 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
291 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>