More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0363 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  100 
 
 
131 aa  268  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  66.41 
 
 
131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  67.19 
 
 
130 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  67.69 
 
 
134 aa  179  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  67.19 
 
 
132 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  67.19 
 
 
130 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  67.19 
 
 
130 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  66.41 
 
 
132 aa  178  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  64.62 
 
 
134 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  66.41 
 
 
132 aa  177  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  66.41 
 
 
130 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  66.41 
 
 
130 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  64.29 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  69.23 
 
 
131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  61.72 
 
 
129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  60 
 
 
129 aa  161  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  55.74 
 
 
314 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  54.1 
 
 
314 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  53.28 
 
 
314 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  53.23 
 
 
127 aa  140  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  53.28 
 
 
314 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  53.28 
 
 
314 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  52.46 
 
 
316 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  53.28 
 
 
315 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  50.82 
 
 
313 aa  137  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  50.82 
 
 
316 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  52.46 
 
 
313 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  51.64 
 
 
315 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  51.56 
 
 
130 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  46.77 
 
 
319 aa  130  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  46.15 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  50 
 
 
317 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  47.14 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  48.78 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  45.31 
 
 
314 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  47.15 
 
 
317 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  41.22 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  44.92 
 
 
306 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  44 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004482  MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  44.27 
 
 
132 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  46.03 
 
 
329 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  44.96 
 
 
137 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  44.96 
 
 
137 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  40.8 
 
 
126 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  40 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  41.18 
 
 
138 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  41.18 
 
 
138 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.94 
 
 
129 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.31 
 
 
131 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.31 
 
 
131 aa  106  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  40.94 
 
 
129 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  40.94 
 
 
129 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  39.68 
 
 
316 aa  105  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  40.94 
 
 
129 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.94 
 
 
129 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.53 
 
 
132 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.54 
 
 
131 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.16 
 
 
129 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.16 
 
 
129 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.76 
 
 
132 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.77 
 
 
131 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.77 
 
 
131 aa  103  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 
134 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  38.52 
 
 
138 aa  102  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.58 
 
 
130 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.53 
 
 
131 aa  101  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
137 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 
133 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  36.51 
 
 
318 aa  98.2  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.68 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  38.52 
 
 
135 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
133 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  40.48 
 
 
347 aa  95.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.58 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.58 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.58 
 
 
128 aa  94.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  38.21 
 
 
137 aa  93.6  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  41.6 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  39.52 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  39.52 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.22 
 
 
360 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.74 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  34.96 
 
 
322 aa  92.8  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  37.6 
 
 
144 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  39.66 
 
 
135 aa  92  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  37.3 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.58 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.6 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  37.3 
 
 
137 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  40 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  40 
 
 
132 aa  90.9  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  37.61 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  36.97 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  40.15 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
129 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  40 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  34.4 
 
 
399 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>