More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2053 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  100 
 
 		 132 aa  267  4e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  79.07 
 
 		 130 aa  210  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  79.07 
 
 		 130 aa  210  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  57.81 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  52.34 
 
 		 136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  50 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  50 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 138 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 141 aa  103  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 129 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  41.09 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  41.13 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 267 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 134 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 167 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 200 aa  89.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  36.89 
 
 		 137 aa  90.1  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  38.84 
 
 		 147 aa  88.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.43 
 
 		 140 aa  87.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.97 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  38.66 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.97 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.97 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  36.97 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  36.21 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.97 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.2 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.2 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.2 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.2 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  39.67 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.4 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  34.62 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.97 
 
 		 135 aa  80.1  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.97 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  34.62 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  44.9 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  36.75 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  36.21 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  33.59 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  35.96 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.71 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 291 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  35.34 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  33.61 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  35.34 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  35.54 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  33.08 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  36.92 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  34.48 
 
 		 347 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  36.21 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  35.34 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.48 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>