More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3866 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 167 aa  323  6e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  69.7 
 
 		 153 aa  171  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  50.38 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 		 128 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 		 130 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 145 aa  96.3  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 144 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  47.24 
 
 		 170 aa  94.4  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  47.5 
 
 		 132 aa  94.4  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  45.59 
 
 		 145 aa  93.6  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 		 124 aa  91.3  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  36.15 
 
 		 132 aa  90.9  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 291 aa  90.5  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  47.97 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 		 138 aa  88.2  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 153 aa  87.4  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 267 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  43.54 
 
 		 144 aa  85.5  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 132 aa  85.1  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 132 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 138 aa  84.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 132 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 		 244 aa  84  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 134 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  40.16 
 
 		 131 aa  84  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  36.59 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  41.26 
 
 		 570 aa  82  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  42.54 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  48.25 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  41.35 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  40.13 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  42.31 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  37.6 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.4 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  37.88 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  37.98 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  37.98 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  37.88 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  40.6 
 
 		 347 aa  74.7  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  37.98 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  31.01 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  40.34 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  43.28 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  41.41 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  43.28 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  30.47 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  39.2 
 
 		 129 aa  72  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  43.09 
 
 		 318 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  34.68 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  42.64 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  36.64 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  36.76 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  39.55 
 
 		 313 aa  71.2  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  39.37 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  40 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  40.71 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  33.06 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  33.06 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  34.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  40 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  39.83 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  35.83 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  36.72 
 
 		 325 aa  67.4  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  38.02 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  29.73 
 
 		 399 aa  67.4  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.82 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>