More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1484 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  100 
 
 
138 aa  267  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  68.85 
 
 
147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  53.17 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  49.19 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  52.1 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  52.89 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  51.15 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  46.28 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 
128 aa  97.4  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  46.49 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  46.61 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 
124 aa  86.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
206 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  49.57 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
132 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
200 aa  80.1  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  42.64 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  45.3 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  38.79 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
291 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  44.33 
 
 
570 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  37.19 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  44.8 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  31.97 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
267 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  40.32 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  35 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
363 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.39 
 
 
386 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  34.17 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.4 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  40.65 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.4 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  38.79 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  43.2 
 
 
312 aa  67.8  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  38 
 
 
399 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
154 aa  66.6  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  38.98 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  36.07 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.94 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  38.1 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  45.22 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  40.68 
 
 
314 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  37.17 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.71 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  36.84 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  36.84 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.67 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  35.25 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.07 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
149 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  36.07 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  32.23 
 
 
384 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.7 
 
 
360 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  38.14 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  36.13 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  40.52 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  38.14 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  38.84 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  40.52 
 
 
318 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>