More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1907 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  100 
 
 
149 aa  293  5e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  54.07 
 
 
135 aa  130  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 
137 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 
133 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
133 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 
133 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  49.19 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  45.19 
 
 
136 aa  111  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  47.2 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  48 
 
 
132 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  48 
 
 
132 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  47.2 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  45.93 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  47.97 
 
 
128 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
138 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  48 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  44.96 
 
 
347 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  44.62 
 
 
137 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 
135 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  46.51 
 
 
134 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  44.96 
 
 
142 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
129 aa  104  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  43.08 
 
 
137 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 
334 aa  103  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  50 
 
 
138 aa  103  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  46.51 
 
 
144 aa  103  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  43.28 
 
 
138 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  42.54 
 
 
138 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  43.28 
 
 
138 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  45.6 
 
 
132 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  49.14 
 
 
138 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 
146 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  49.14 
 
 
138 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  43.08 
 
 
135 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  47.06 
 
 
135 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  41.53 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  44.19 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  36.8 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  38.46 
 
 
310 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  32.58 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  36.96 
 
 
318 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  38.17 
 
 
322 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  37.8 
 
 
312 aa  75.1  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  35.16 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  38.1 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  37.14 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  34.88 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  34.88 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  34.85 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  34.4 
 
 
363 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.92 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  32.31 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.13 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  38.26 
 
 
319 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.71 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  39.2 
 
 
315 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  39.84 
 
 
313 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.13 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  36.72 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.13 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  29.85 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  34.35 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  32.33 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  34.81 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  38.4 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  30.83 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  33.33 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  33.33 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  33.33 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  37.01 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  34.88 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  35.66 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  33.33 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  37.5 
 
 
313 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  31.85 
 
 
325 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  33.33 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  35.07 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.45 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  37.29 
 
 
302 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  33.58 
 
 
132 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  34.09 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
136 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  34.09 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  41.05 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>