More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4811 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 138 aa  269  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  92.75 
 
 		 138 aa  222  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  78.99 
 
 		 138 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  78.79 
 
 		 150 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  75 
 
 		 137 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  78.03 
 
 		 133 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  79.69 
 
 		 129 aa  209  7.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  76.69 
 
 		 133 aa  209  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  81.82 
 
 		 144 aa  208  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  74.65 
 
 		 142 aa  207  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  77.27 
 
 		 133 aa  207  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  78.63 
 
 		 137 aa  207  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  76.52 
 
 		 133 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  83.74 
 
 		 136 aa  206  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  77.27 
 
 		 132 aa  206  9e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  77.27 
 
 		 132 aa  206  9e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  76.15 
 
 		 135 aa  204  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  76.15 
 
 		 137 aa  204  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  80.43 
 
 		 138 aa  203  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  76.52 
 
 		 132 aa  203  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  73.28 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  75 
 
 		 132 aa  201  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  74.81 
 
 		 138 aa  201  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  74.81 
 
 		 138 aa  201  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  81.88 
 
 		 138 aa  198  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  81.88 
 
 		 138 aa  198  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  73.28 
 
 		 135 aa  196  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  69.12 
 
 		 136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  71.21 
 
 		 132 aa  193  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  73.44 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  78.51 
 
 		 135 aa  192  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  71.21 
 
 		 151 aa  188  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  68.7 
 
 		 347 aa  187  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  71.32 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  75.21 
 
 		 146 aa  178  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  66.92 
 
 		 334 aa  174  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  67.5 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  55.64 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  60.45 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  48.87 
 
 		 318 aa  114  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  46.46 
 
 		 315 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  47.24 
 
 		 313 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  44.88 
 
 		 315 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  46.67 
 
 		 312 aa  100  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.36 
 
 		 135 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  46.21 
 
 		 320 aa  98.6  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 		 139 aa  98.2  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  44.09 
 
 		 314 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.36 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  44.09 
 
 		 314 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  43.31 
 
 		 316 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  44.36 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.36 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.36 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  45.45 
 
 		 320 aa  97.1  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 		 129 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  42.52 
 
 		 316 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  45.31 
 
 		 310 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  43.31 
 
 		 314 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  40.74 
 
 		 400 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  46.46 
 
 		 316 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  42.52 
 
 		 314 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 150 aa  93.6  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  45.38 
 
 		 315 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  46.22 
 
 		 302 aa  93.6  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  43.9 
 
 		 314 aa  93.6  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  38.89 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  36.59 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  43.44 
 
 		 306 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 		 138 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  37.6 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  45.74 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  40.3 
 
 		 352 aa  90.5  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  39.34 
 
 		 329 aa  90.9  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  37.6 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  40.94 
 
 		 325 aa  90.1  8e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.6 
 
 		 396 aa  90.1  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  38.4 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  37.9 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>