More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1102 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  100 
 
 
136 aa  275  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  43.31 
 
 
325 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  44.8 
 
 
130 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
134 aa  98.6  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  48.18 
 
 
312 aa  97.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  45.74 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.55 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.55 
 
 
138 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.55 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  43.85 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.13 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.13 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.13 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.13 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.13 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  42.31 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  41.13 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.74 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.74 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  40.6 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
149 aa  88.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  43.51 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  39.37 
 
 
310 aa  88.2  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  40.6 
 
 
314 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  43.08 
 
 
136 aa  87.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  40 
 
 
319 aa  87.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  42.75 
 
 
149 aa  87  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  43.85 
 
 
142 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  43.85 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  42.75 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  42.75 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  42.75 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  42.75 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.94 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  36.51 
 
 
127 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  41.98 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  42.75 
 
 
149 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  40.8 
 
 
316 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  34.4 
 
 
131 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  42.5 
 
 
315 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  34.92 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  42.75 
 
 
334 aa  84.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
152 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  43.08 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  43.08 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  42.5 
 
 
313 aa  84  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
148 aa  84  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  42.98 
 
 
317 aa  84  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  39.37 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  40 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  39.37 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  41.73 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  39.22 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  40.83 
 
 
315 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  40.65 
 
 
322 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  37.1 
 
 
321 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  41.67 
 
 
313 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  42.86 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  34.13 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  39.23 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  34.13 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  34.13 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  34.65 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  35.11 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  35.2 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  42.86 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  34.13 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  42.48 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  42.48 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  35.71 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  35.71 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  41.74 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  34.13 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  40.77 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>