More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0799 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  100 
 
 
148 aa  300  6.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  99.32 
 
 
148 aa  297  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  83.11 
 
 
151 aa  250  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  80.27 
 
 
155 aa  233  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  78.47 
 
 
172 aa  233  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  76.09 
 
 
150 aa  213  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  66.41 
 
 
159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  65.91 
 
 
151 aa  181  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  64.12 
 
 
166 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  63.5 
 
 
166 aa  172  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  58.99 
 
 
153 aa  168  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  62.2 
 
 
137 aa  166  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  61.19 
 
 
149 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  61.19 
 
 
149 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  61.07 
 
 
149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  59.85 
 
 
334 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  60.77 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  60.31 
 
 
149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  60.31 
 
 
149 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  60.31 
 
 
149 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  60.31 
 
 
149 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  57.86 
 
 
142 aa  161  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  60.31 
 
 
149 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  59.23 
 
 
141 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  61.72 
 
 
147 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  58.82 
 
 
142 aa  157  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  59.38 
 
 
147 aa  153  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  57.03 
 
 
147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  57.03 
 
 
147 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  57.03 
 
 
147 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  57.03 
 
 
147 aa  150  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 
153 aa  143  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 
152 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  58.14 
 
 
138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  47.58 
 
 
325 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  48.72 
 
 
312 aa  113  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  49.61 
 
 
316 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  47.33 
 
 
314 aa  110  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  47.15 
 
 
310 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  51.52 
 
 
329 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  51.52 
 
 
329 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 
169 aa  95.9  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.72 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  49.51 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  43.22 
 
 
347 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.72 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.72 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  41.8 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  41.8 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  41.8 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
133 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.66 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  43.69 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  40.98 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  40.98 
 
 
130 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  40.68 
 
 
315 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  40.98 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  42.5 
 
 
315 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
141 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  40.16 
 
 
130 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
136 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  46 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  40.91 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  41.75 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  42.72 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  40.91 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  36.96 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  43.69 
 
 
313 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  44.55 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  36.96 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  41.67 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  38.28 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  49 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  37.68 
 
 
306 aa  81.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  42.72 
 
 
129 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  47.37 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  44.44 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  41.73 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  42.57 
 
 
317 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  41.73 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  45.54 
 
 
334 aa  80.5  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.31 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.03 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  45.63 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40.16 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  41.67 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  44.17 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  42.15 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  39.85 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  41.22 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  41.22 
 
 
132 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  47.62 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.31 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  36.5 
 
 
314 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  41.18 
 
 
322 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>