More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2831 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  89.26 
 
 		 149 aa  278  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  87.25 
 
 		 149 aa  273  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  68.28 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  66.44 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  66.44 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  66.44 
 
 		 147 aa  204  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  68.79 
 
 		 142 aa  203  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  66.22 
 
 		 147 aa  202  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  72.87 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  66.67 
 
 		 149 aa  200  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  64.67 
 
 		 334 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  72.09 
 
 		 141 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  65.99 
 
 		 149 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  65.99 
 
 		 149 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  65.99 
 
 		 149 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  65.99 
 
 		 149 aa  197  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  69.92 
 
 		 149 aa  195  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  65.31 
 
 		 149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  65.52 
 
 		 153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  65.28 
 
 		 147 aa  193  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  62.34 
 
 		 152 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  62.34 
 
 		 152 aa  192  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  63.91 
 
 		 150 aa  175  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  63.16 
 
 		 151 aa  174  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  55.03 
 
 		 172 aa  170  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  58.99 
 
 		 148 aa  168  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  58.99 
 
 		 148 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  62.12 
 
 		 166 aa  167  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  59.4 
 
 		 155 aa  166  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  60.77 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 166 aa  159  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  58.14 
 
 		 137 aa  153  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  54.2 
 
 		 138 aa  147  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  52.34 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  57.03 
 
 		 314 aa  137  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  57.89 
 
 		 312 aa  130  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  52.07 
 
 		 325 aa  124  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  48.61 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  48.44 
 
 		 316 aa  110  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  45.08 
 
 		 310 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  44.12 
 
 		 347 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  49.49 
 
 		 329 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  49.49 
 
 		 329 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  49.51 
 
 		 130 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  46.6 
 
 		 132 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  46.6 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  43.22 
 
 		 315 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  45.63 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  50.49 
 
 		 313 aa  96.7  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  42.86 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  46.88 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  46.88 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  41.46 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  40.65 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  43.69 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 132 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  41.46 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  44.54 
 
 		 319 aa  92  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  52.34 
 
 		 136 aa  91.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  43.4 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  42.5 
 
 		 315 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  43.09 
 
 		 314 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  45.63 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  43.18 
 
 		 138 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  39.84 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  48.18 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  45.38 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  47.52 
 
 		 313 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  40 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  41.09 
 
 		 315 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  48.62 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  41.09 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  42.59 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  37.3 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  41.46 
 
 		 314 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  45.37 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  43.81 
 
 		 316 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  42.59 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  45.37 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  37.3 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  40.31 
 
 		 315 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  41.46 
 
 		 314 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  40.38 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  41.35 
 
 		 317 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  34.68 
 
 		 132 aa  85.5  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  43.81 
 
 		 316 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40.65 
 
 		 314 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  42.61 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  40.31 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  41.13 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  47.32 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  38.93 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>