More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0831 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  100 
 
 
166 aa  336  8e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  89.4 
 
 
151 aa  279  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  74.68 
 
 
159 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  68.94 
 
 
137 aa  191  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  65.79 
 
 
166 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  66.42 
 
 
151 aa  181  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  61.22 
 
 
172 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  64.12 
 
 
148 aa  176  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  61.48 
 
 
142 aa  173  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  63.36 
 
 
148 aa  173  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  63.43 
 
 
155 aa  173  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  61.94 
 
 
141 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  60.61 
 
 
150 aa  171  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  64.62 
 
 
147 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  61.36 
 
 
149 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  62.12 
 
 
153 aa  167  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  61.36 
 
 
149 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  63.85 
 
 
149 aa  166  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  59.44 
 
 
334 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  59.44 
 
 
149 aa  163  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  59.44 
 
 
149 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  59.44 
 
 
149 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  59.44 
 
 
149 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  59.44 
 
 
149 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 
147 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  58.74 
 
 
149 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 
147 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 
147 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 
147 aa  160  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  60.15 
 
 
152 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  58.78 
 
 
147 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  60.15 
 
 
152 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 
153 aa  153  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  55.75 
 
 
312 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  45.39 
 
 
325 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  48.82 
 
 
314 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 
138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
137 aa  107  9.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  45.9 
 
 
310 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  46.34 
 
 
316 aa  103  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  48.51 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  42.86 
 
 
132 aa  95.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  45.1 
 
 
329 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  42.06 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  45.1 
 
 
329 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  49.54 
 
 
141 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  40.16 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  44.55 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  46.53 
 
 
134 aa  86.3  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  38.89 
 
 
130 aa  85.1  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  40.83 
 
 
315 aa  85.1  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  46.53 
 
 
313 aa  84.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  43.56 
 
 
130 aa  84  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  43.56 
 
 
130 aa  84  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40.83 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  44.66 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.83 
 
 
316 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  42.57 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  36.29 
 
 
132 aa  82  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  38.33 
 
 
316 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.35 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  43.81 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  39.62 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  44.66 
 
 
313 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.4 
 
 
134 aa  79  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.58 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  40.38 
 
 
317 aa  78.2  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.77 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  41.51 
 
 
347 aa  77.8  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  38.02 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.38 
 
 
131 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  43.69 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  42.59 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  37.1 
 
 
319 aa  75.5  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  40 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  39.55 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  39.55 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  38.61 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  39.42 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  40.91 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  42.57 
 
 
315 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  42.57 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  42.57 
 
 
315 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  38.52 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  40.74 
 
 
142 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  42.57 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  36.64 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  38.89 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  41.28 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  40.38 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>