More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2711 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  96.64 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  89.26 
 
 		 153 aa  278  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  68.79 
 
 		 142 aa  201  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  72.09 
 
 		 142 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  67.41 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  66.91 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  66.91 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  66.91 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  69.47 
 
 		 141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  70.54 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  65.52 
 
 		 149 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  63.76 
 
 		 334 aa  191  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  64.83 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  64.83 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  64.83 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  64.83 
 
 		 149 aa  190  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  64.58 
 
 		 147 aa  189  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  63.33 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  67.67 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  60.78 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  60.78 
 
 		 152 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  62.68 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  61.87 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  56.55 
 
 		 172 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  63.36 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  61.83 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  63.28 
 
 		 151 aa  167  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  61.36 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  61.19 
 
 		 148 aa  166  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  61.19 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  58.52 
 
 		 159 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  59.4 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  58.14 
 
 		 137 aa  153  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 		 138 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  50.78 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  54.69 
 
 		 314 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  55.17 
 
 		 312 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  51.22 
 
 		 325 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 		 169 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  48.82 
 
 		 316 aa  113  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  45.08 
 
 		 310 aa  110  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  42.45 
 
 		 347 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  49.49 
 
 		 329 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  49.49 
 
 		 329 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  47.57 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  46.6 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  43.22 
 
 		 315 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  49.51 
 
 		 130 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  46.6 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  43.9 
 
 		 130 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  43.9 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  43.09 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  49.51 
 
 		 313 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  44.66 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  42.28 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  40.97 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  41.86 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  40 
 
 		 129 aa  94  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  44.96 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  44.96 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  43.4 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  43.7 
 
 		 319 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  42.64 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  49.53 
 
 		 136 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  41.35 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  40 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  43.52 
 
 		 134 aa  90.5  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  43.51 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  40.83 
 
 		 315 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 136 aa  88.6  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  44.66 
 
 		 315 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  45.87 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  45.45 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  41.35 
 
 		 317 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  45.87 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  33.59 
 
 		 132 aa  87.4  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  41.46 
 
 		 314 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  44.66 
 
 		 313 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  44.55 
 
 		 138 aa  87  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 316 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  42.86 
 
 		 316 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.98 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  43.52 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  39.68 
 
 		 315 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  43.52 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  39.84 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  39.2 
 
 		 128 aa  85.5  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.17 
 
 		 138 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  45.37 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  38.4 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  43.44 
 
 		 133 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.43 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  39.84 
 
 		 314 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.06 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  39.84 
 
 		 314 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>