More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2908 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 159 aa  322  9e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  78 
 
 		 151 aa  240  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  74.68 
 
 		 166 aa  238  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  66.25 
 
 		 166 aa  197  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  67.16 
 
 		 151 aa  187  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  66.92 
 
 		 137 aa  187  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  66.41 
 
 		 148 aa  183  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  66.18 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  66.41 
 
 		 148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  61.22 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  60.56 
 
 		 150 aa  177  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  64.62 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  60.14 
 
 		 149 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  59.44 
 
 		 334 aa  166  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  59.44 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  59.44 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  59.44 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  59.44 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  59.44 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  58.52 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  59.26 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  58.52 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  59.7 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  58.96 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  60 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  60.31 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  58.91 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  58.91 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  58.91 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  58.91 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  58.78 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  55.22 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  55.22 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 153 aa  143  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  52.99 
 
 		 312 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  50.77 
 
 		 314 aa  121  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  48.8 
 
 		 325 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 138 aa  115  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  47.66 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  49.22 
 
 		 316 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  47.11 
 
 		 310 aa  104  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  44.44 
 
 		 329 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  44.44 
 
 		 329 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 169 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  42.57 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  37.5 
 
 		 315 aa  84  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  42.57 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  42.57 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  43.56 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  43.56 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  43.56 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  41.13 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  46.53 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  42.57 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  40.59 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  41.58 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.53 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  37.88 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  39.39 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  43.52 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.16 
 
 		 132 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  41.58 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.43 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.39 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  39.55 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  39.26 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  42.37 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  42.57 
 
 		 314 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  39.42 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  39.39 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.65 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  46.08 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  41.22 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  39.69 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  39.69 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  39.06 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  38.58 
 
 		 319 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  42.37 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  42.57 
 
 		 317 aa  71.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  42.37 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  41.75 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  33.06 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  43.56 
 
 		 313 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  39.81 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  41.35 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  41.58 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.18 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  42.45 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  38.1 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>