More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7592 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  100 
 
 
136 aa  273  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  86.36 
 
 
133 aa  233  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  83.46 
 
 
133 aa  230  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  81.95 
 
 
150 aa  226  7e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  80.6 
 
 
137 aa  225  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  81.4 
 
 
129 aa  224  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  80.45 
 
 
133 aa  223  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  81.06 
 
 
138 aa  219  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  77.27 
 
 
133 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  75.57 
 
 
137 aa  209  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  75.57 
 
 
142 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  75 
 
 
132 aa  206  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  75 
 
 
132 aa  206  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  71.85 
 
 
135 aa  204  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  73.08 
 
 
137 aa  203  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  73.48 
 
 
132 aa  202  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  70.99 
 
 
138 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  76.69 
 
 
144 aa  201  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  72.52 
 
 
138 aa  201  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  72.52 
 
 
138 aa  201  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  70.77 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  82.35 
 
 
138 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  82.91 
 
 
138 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  79.17 
 
 
138 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  71.97 
 
 
151 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  69.17 
 
 
136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  78.33 
 
 
135 aa  193  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  71.21 
 
 
132 aa  193  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  70.54 
 
 
134 aa  191  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  79.49 
 
 
138 aa  191  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  79.49 
 
 
138 aa  191  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  71.09 
 
 
128 aa  191  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  68.94 
 
 
132 aa  189  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  66.41 
 
 
347 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  66.92 
 
 
334 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  74.36 
 
 
146 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  66.94 
 
 
137 aa  168  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  57.03 
 
 
138 aa  159  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  56.62 
 
 
135 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  63.2 
 
 
142 aa  146  9e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  49.6 
 
 
153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  50 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  47.58 
 
 
318 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  44.8 
 
 
315 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  43.2 
 
 
315 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  45.6 
 
 
313 aa  97.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
138 aa  97.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  45.83 
 
 
312 aa  97.1  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 
135 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.75 
 
 
310 aa  95.5  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
126 aa  94  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 
135 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 
135 aa  94  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 
135 aa  93.6  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  43.61 
 
 
135 aa  94  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 
135 aa  94  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  46.21 
 
 
141 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.41 
 
 
138 aa  93.2  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 
147 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
135 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
139 aa  93.2  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.41 
 
 
138 aa  93.2  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  43.36 
 
 
306 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  35.11 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  36.64 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  44.7 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.41 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  48.41 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.64 
 
 
138 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  42.86 
 
 
315 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
149 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  44.88 
 
 
316 aa  92.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  36.59 
 
 
131 aa  92.8  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.64 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  43.33 
 
 
314 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.52 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
128 aa  90.5  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.52 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.52 
 
 
128 aa  90.9  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  43.41 
 
 
320 aa  89.4  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  38.58 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.69 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  42.86 
 
 
302 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.7 
 
 
131 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  38.46 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
129 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  40.17 
 
 
317 aa  88.2  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.92 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  42.62 
 
 
400 aa  88.2  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
129 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  40 
 
 
316 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  42.24 
 
 
321 aa  87.8  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>