More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2661 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  100 
 
 
147 aa  297  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  88.64 
 
 
141 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  88.64 
 
 
142 aa  243  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  77.55 
 
 
334 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  77.55 
 
 
149 aa  223  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  77.55 
 
 
149 aa  222  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  77.55 
 
 
149 aa  222  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  77.55 
 
 
149 aa  222  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  77.55 
 
 
149 aa  222  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  74.83 
 
 
147 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  74.83 
 
 
147 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  74.83 
 
 
147 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  76.87 
 
 
149 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  81.25 
 
 
142 aa  219  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  74.15 
 
 
147 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  82.17 
 
 
149 aa  217  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  78.12 
 
 
147 aa  213  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  71.05 
 
 
152 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  71.05 
 
 
152 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  75.37 
 
 
153 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  72.87 
 
 
153 aa  201  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  70.54 
 
 
149 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  70.54 
 
 
149 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 
151 aa  174  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  64.62 
 
 
159 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 
150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  64.62 
 
 
166 aa  169  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  58.5 
 
 
172 aa  166  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  64.62 
 
 
151 aa  166  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  61.72 
 
 
148 aa  160  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 
155 aa  159  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  61.72 
 
 
148 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  60.74 
 
 
138 aa  157  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  62.41 
 
 
166 aa  157  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 
137 aa  154  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  60.8 
 
 
137 aa  154  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  58.97 
 
 
312 aa  138  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  52.8 
 
 
325 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  53.85 
 
 
314 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  52.07 
 
 
310 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  54.33 
 
 
316 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  47.24 
 
 
329 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  47.24 
 
 
329 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
151 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  57.58 
 
 
313 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  52.48 
 
 
130 aa  103  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  48.03 
 
 
347 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  55.56 
 
 
314 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  47.17 
 
 
315 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 
169 aa  100  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  46.61 
 
 
137 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  47.06 
 
 
315 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  44.74 
 
 
317 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  49.02 
 
 
128 aa  97.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  53.54 
 
 
314 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  43.17 
 
 
137 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  45.9 
 
 
319 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  53.54 
 
 
314 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  52.53 
 
 
313 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  44.35 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  43.55 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  52.53 
 
 
314 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  43.55 
 
 
130 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  45.74 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  37.9 
 
 
132 aa  94.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  50.5 
 
 
316 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  46.21 
 
 
132 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  46.21 
 
 
132 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  44.92 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  42.96 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  51.52 
 
 
315 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  42.74 
 
 
130 aa  93.6  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.84 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  47.47 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  47.47 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  45.67 
 
 
132 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  48.42 
 
 
302 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  47.47 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  51.52 
 
 
315 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  49.49 
 
 
314 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  45.37 
 
 
138 aa  91.7  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  46.51 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  45.45 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  42.06 
 
 
127 aa  90.5  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.02 
 
 
131 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  46.46 
 
 
130 aa  90.1  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  48.51 
 
 
316 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  43.51 
 
 
136 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  47.52 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 
135 aa  87.8  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  39.52 
 
 
131 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  44.26 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>