More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_13370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  617  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  77.64 
 
 
313 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  75.56 
 
 
315 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  73.16 
 
 
316 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  74.92 
 
 
315 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  72.2 
 
 
314 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  73.16 
 
 
314 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  72.84 
 
 
314 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  70.93 
 
 
316 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  72.52 
 
 
314 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  70.61 
 
 
314 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  49.05 
 
 
321 aa  285  7e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  47.92 
 
 
314 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  45.95 
 
 
306 aa  240  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  45.02 
 
 
317 aa  235  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  46.79 
 
 
322 aa  231  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  44.59 
 
 
318 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  44.34 
 
 
315 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  44.26 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  43.99 
 
 
329 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  44.94 
 
 
319 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  42.04 
 
 
310 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  38.98 
 
 
316 aa  202  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  41.23 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  42.17 
 
 
320 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  41.85 
 
 
320 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  39.35 
 
 
325 aa  185  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  42 
 
 
312 aa  182  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  40.58 
 
 
316 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  39.44 
 
 
314 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  36.59 
 
 
329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  36.59 
 
 
329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  54.47 
 
 
132 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  54.47 
 
 
132 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  53.66 
 
 
130 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  53.66 
 
 
132 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  53.28 
 
 
130 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  52.46 
 
 
130 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  52.46 
 
 
130 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  49.59 
 
 
129 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  53.28 
 
 
134 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  51.64 
 
 
130 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  50.82 
 
 
131 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  50 
 
 
134 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  51.22 
 
 
129 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
352 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  50 
 
 
132 aa  132  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  50 
 
 
129 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  49.19 
 
 
132 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  48.36 
 
 
131 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  53.6 
 
 
127 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  44.62 
 
 
194 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  44.1 
 
 
194 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004482  MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  50.81 
 
 
132 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  51.22 
 
 
131 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  45.97 
 
 
133 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  40.31 
 
 
198 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  50.41 
 
 
128 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1604  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
369 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000210752  hitchhiker  0.0000224711 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  44.27 
 
 
194 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  38.74 
 
 
212 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  43.3 
 
 
194 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.74 
 
 
199 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  48.39 
 
 
137 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  48.39 
 
 
142 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  50 
 
 
137 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  47.5 
 
 
135 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  47.29 
 
 
132 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
132 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 
134 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  48.06 
 
 
132 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  48.06 
 
 
132 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  46.62 
 
 
130 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  43.75 
 
 
144 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 
360 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  45.31 
 
 
136 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 
135 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  46.67 
 
 
138 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  49.21 
 
 
347 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  43.3 
 
 
194 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  43.3 
 
 
194 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  43.3 
 
 
194 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  56.31 
 
 
141 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  44.35 
 
 
138 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  44.35 
 
 
138 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  55.34 
 
 
142 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
133 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  48.84 
 
 
144 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  48.06 
 
 
132 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.26 
 
 
131 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  45.24 
 
 
134 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  44.44 
 
 
134 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  41.15 
 
 
196 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  48 
 
 
137 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  57.58 
 
 
147 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  41.46 
 
 
126 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  46.03 
 
 
134 aa  105  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  39.9 
 
 
209 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  39.9 
 
 
209 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>