More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4453 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  100 
 
 
144 aa  297  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  52.14 
 
 
129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  51.41 
 
 
130 aa  137  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  49.31 
 
 
134 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  54.74 
 
 
127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  49.65 
 
 
132 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  52.17 
 
 
129 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  48.95 
 
 
132 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  48.95 
 
 
132 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  49.3 
 
 
130 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  47.89 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  47.14 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  50.71 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  47.89 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  47.89 
 
 
130 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  45.71 
 
 
131 aa  123  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  47.89 
 
 
130 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  47.45 
 
 
129 aa  120  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  45.65 
 
 
317 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  45.59 
 
 
319 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  47.01 
 
 
314 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  47.76 
 
 
317 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  48.51 
 
 
316 aa  114  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  45.52 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  47.76 
 
 
316 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  47.76 
 
 
315 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  45.52 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  45.52 
 
 
314 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  43.75 
 
 
313 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  47.01 
 
 
315 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  45.52 
 
 
314 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  42.03 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  43.06 
 
 
313 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  46.76 
 
 
131 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.29 
 
 
132 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  37.68 
 
 
132 aa  103  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  41.91 
 
 
314 aa  103  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  44.6 
 
 
329 aa  103  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.35 
 
 
321 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.3 
 
 
134 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  46.15 
 
 
126 aa  99.4  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.15 
 
 
131 aa  98.6  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.34 
 
 
134 aa  98.2  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  42.34 
 
 
128 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.42 
 
 
131 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  38.13 
 
 
316 aa  94.7  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  37.86 
 
 
132 aa  93.6  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.88 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.88 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.88 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.15 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.15 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.44 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.15 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.44 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  38.69 
 
 
137 aa  90.1  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  38.69 
 
 
137 aa  90.1  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  37.68 
 
 
352 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  37.96 
 
 
129 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  37.96 
 
 
129 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.41 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.96 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  37.96 
 
 
129 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.96 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.96 
 
 
129 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004482  MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  38.41 
 
 
132 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.23 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  37.69 
 
 
306 aa  87.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  37.14 
 
 
132 aa  87  7e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  36.96 
 
 
352 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.23 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.5 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  36.5 
 
 
130 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  35.25 
 
 
139 aa  84  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  38.64 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  38.64 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  35.46 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  37.04 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  32.64 
 
 
399 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  80.1  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  34.06 
 
 
386 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.57 
 
 
396 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  41.53 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
134 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  33.33 
 
 
400 aa  77  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  41.53 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  41.53 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  41.53 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  41.53 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  41.53 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  41.53 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  33.33 
 
 
315 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  41.53 
 
 
334 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  34.06 
 
 
383 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>