More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0410 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  100 
 
 
130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  90 
 
 
132 aa  243  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  90 
 
 
132 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  89.23 
 
 
132 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  84.5 
 
 
134 aa  226  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  81.54 
 
 
130 aa  220  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  80 
 
 
130 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  80 
 
 
130 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  80 
 
 
130 aa  217  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  70.31 
 
 
134 aa  189  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  68.25 
 
 
129 aa  188  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  67.19 
 
 
131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  67.2 
 
 
129 aa  180  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  67.19 
 
 
131 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  67.97 
 
 
129 aa  179  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  71.88 
 
 
131 aa  169  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  56.91 
 
 
314 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  56.91 
 
 
314 aa  150  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  55.28 
 
 
314 aa  150  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  53.23 
 
 
319 aa  149  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  56.91 
 
 
314 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  54.47 
 
 
316 aa  148  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  53.66 
 
 
316 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  56.1 
 
 
314 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  53.66 
 
 
313 aa  146  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  56.8 
 
 
127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  53.66 
 
 
313 aa  144  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  52.46 
 
 
315 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  50.82 
 
 
315 aa  137  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  51.41 
 
 
144 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  47.29 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  50.39 
 
 
132 aa  133  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  46.4 
 
 
126 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  47.15 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  49.18 
 
 
317 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  48.03 
 
 
133 aa  127  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  49.19 
 
 
128 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  45.16 
 
 
314 aa  122  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  45.16 
 
 
321 aa  121  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004482  MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  48.84 
 
 
132 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  45.76 
 
 
306 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  47.24 
 
 
329 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  49.6 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  46.4 
 
 
137 aa  114  5e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  46.4 
 
 
137 aa  114  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  42.06 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44.8 
 
 
131 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44 
 
 
131 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 
132 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44 
 
 
131 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 
129 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  42.4 
 
 
129 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  42.4 
 
 
129 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  42.4 
 
 
129 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.4 
 
 
129 aa  107  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.19 
 
 
134 aa  107  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 
132 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 
131 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 
129 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 
129 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 
131 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  37.98 
 
 
138 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  43.2 
 
 
347 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  42.06 
 
 
329 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  38.21 
 
 
322 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  42.06 
 
 
329 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  37.98 
 
 
138 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  42.98 
 
 
134 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  42.98 
 
 
134 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  40.6 
 
 
135 aa  101  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
137 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  40.94 
 
 
316 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  41.46 
 
 
310 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  38.4 
 
 
138 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.16 
 
 
132 aa  100  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  38.02 
 
 
386 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  38.84 
 
 
352 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.16 
 
 
396 aa  98.6  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.58 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  43.55 
 
 
132 aa  97.8  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  38.02 
 
 
352 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  35.83 
 
 
315 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  41.91 
 
 
360 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  39.37 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  39.2 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  38.58 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  40 
 
 
130 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  38.46 
 
 
302 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  44.66 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  37.1 
 
 
400 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  37.8 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
135 aa  93.6  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
133 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  43.69 
 
 
149 aa  93.6  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  40.94 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>