More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0475 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 152 aa  309  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 152 aa  309  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  92.11 
 
 		 147 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  92.11 
 
 		 147 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  92.11 
 
 		 147 aa  276  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  89.33 
 
 		 153 aa  272  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  91.39 
 
 		 147 aa  271  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  80.41 
 
 		 334 aa  238  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  81.08 
 
 		 149 aa  236  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  81.08 
 
 		 149 aa  236  8e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  81.08 
 
 		 149 aa  236  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  81.08 
 
 		 149 aa  236  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  80.41 
 
 		 149 aa  234  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  80.41 
 
 		 149 aa  234  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  80.13 
 
 		 149 aa  233  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  72.19 
 
 		 142 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  76.81 
 
 		 141 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  71.05 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  62.34 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  69.4 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  60.78 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  66.2 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  61.18 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  60.43 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  55.8 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  60.15 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  55.41 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  58.96 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  55.15 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  55.22 
 
 		 159 aa  144  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  56.82 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 138 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  54.01 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  59.46 
 
 		 312 aa  131  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  52.99 
 
 		 314 aa  120  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  55.96 
 
 		 325 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  45.38 
 
 		 310 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  46.4 
 
 		 329 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  46.4 
 
 		 329 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  49.54 
 
 		 169 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  47.73 
 
 		 316 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  49.04 
 
 		 315 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  56.82 
 
 		 316 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  46.3 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  54.74 
 
 		 313 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  52.75 
 
 		 314 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  43.8 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  41.09 
 
 		 317 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  53.41 
 
 		 314 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  53.41 
 
 		 314 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  53.41 
 
 		 314 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  53.41 
 
 		 314 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  41.38 
 
 		 347 aa  87  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  38.84 
 
 		 132 aa  86.7  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.55 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.55 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.55 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  42.06 
 
 		 319 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.97 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  51.16 
 
 		 316 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  42.62 
 
 		 315 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.97 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  50 
 
 		 313 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  39.86 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.04 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  40.46 
 
 		 127 aa  83.6  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40.85 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.31 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  40.14 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  42.59 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.31 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  42.59 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  48.89 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  42.16 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.92 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  41.67 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  40 
 
 		 318 aa  80.9  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  44.44 
 
 		 302 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.56 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  42.2 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  43.2 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  42.4 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  42.16 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  44.44 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  42.62 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  43.64 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  42.62 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  41.04 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  42.5 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  41.67 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>