More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0397 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  100 
 
 
347 aa  701    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  48.14 
 
 
334 aa  279  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  71.76 
 
 
132 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  71.76 
 
 
132 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  70.99 
 
 
132 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  68.18 
 
 
136 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  70.23 
 
 
132 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  71.09 
 
 
128 aa  195  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  69.92 
 
 
144 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  69.7 
 
 
137 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  65.91 
 
 
137 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  66.41 
 
 
132 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  65.91 
 
 
142 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  64.93 
 
 
135 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  65.69 
 
 
151 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  66.92 
 
 
135 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  66.92 
 
 
133 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  66.41 
 
 
137 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  64.39 
 
 
138 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  63.64 
 
 
134 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  64.89 
 
 
133 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  63.31 
 
 
150 aa  180  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  64.18 
 
 
138 aa  179  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  64.18 
 
 
138 aa  179  8e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  64.12 
 
 
133 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  64.06 
 
 
129 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  66.39 
 
 
136 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  64.12 
 
 
138 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  62.6 
 
 
133 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  68.33 
 
 
135 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  69.23 
 
 
138 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  66.67 
 
 
138 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  57.97 
 
 
138 aa  167  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 
138 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  66.67 
 
 
138 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  66.67 
 
 
138 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  59.17 
 
 
137 aa  162  8.000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  64.96 
 
 
146 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  54.48 
 
 
135 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
142 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  48.89 
 
 
318 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  50.79 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
153 aa  113  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  48.06 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  49.61 
 
 
314 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  50.39 
 
 
314 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  49.21 
 
 
313 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  48.84 
 
 
315 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  48.84 
 
 
314 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  46.32 
 
 
138 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 
149 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  44.8 
 
 
132 aa  106  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 
149 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
137 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  44.44 
 
 
317 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  49.55 
 
 
141 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.65 
 
 
310 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  45.74 
 
 
316 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  50.94 
 
 
142 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  42.5 
 
 
383 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  38.4 
 
 
133 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 
147 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  43.2 
 
 
130 aa  102  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  44.07 
 
 
312 aa  102  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  44.12 
 
 
153 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  45.38 
 
 
313 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
147 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  47.11 
 
 
302 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  44.26 
 
 
130 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
138 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  44.63 
 
 
314 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  44.96 
 
 
314 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  41.73 
 
 
132 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  42.86 
 
 
131 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  41.73 
 
 
132 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 
147 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 
147 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 
147 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  42.62 
 
 
130 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  39.84 
 
 
129 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  39.2 
 
 
132 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  42.62 
 
 
130 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  43.09 
 
 
325 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 
147 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  42.62 
 
 
130 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
142 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  43.41 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  39.68 
 
 
129 aa  97.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  42.18 
 
 
169 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  43.33 
 
 
319 aa  97.1  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  46.15 
 
 
149 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  36.8 
 
 
132 aa  96.3  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  39.53 
 
 
329 aa  96.3  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  45.45 
 
 
130 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  44.29 
 
 
320 aa  95.9  9e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  46.56 
 
 
149 aa  95.9  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.2 
 
 
134 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 
149 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  42.37 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  40.48 
 
 
131 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>