More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2650 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  615  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  38.65 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  38.27 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  34.25 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  34.68 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  32.06 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  28.93 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  33.55 
 
 		 322 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  35.53 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  31.74 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  34.87 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  33.86 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  34.25 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  34.26 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  33.47 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  33.2 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  33.07 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  33.07 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  32.67 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  32.67 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  37.99 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  37.99 
 
 		 329 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  33.59 
 
 		 306 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 147 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  45.3 
 
 		 147 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  31.87 
 
 		 314 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  32.94 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  32.94 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 142 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 		 138 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  36.8 
 
 		 132 aa  98.2  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  45.16 
 
 		 149 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  47.97 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  44.35 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  28.67 
 
 		 317 aa  96.3  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  44.35 
 
 		 149 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  44.35 
 
 		 149 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  44.35 
 
 		 149 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  29.6 
 
 		 314 aa  95.5  9e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  44.35 
 
 		 149 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  44.35 
 
 		 149 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  45.3 
 
 		 147 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  45.76 
 
 		 141 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  45.3 
 
 		 147 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  45.3 
 
 		 147 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.17 
 
 		 128 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.17 
 
 		 128 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  32.29 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  44.92 
 
 		 142 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.17 
 
 		 128 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 147 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  44.44 
 
 		 149 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.2 
 
 		 131 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  44.63 
 
 		 153 aa  90.5  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  42.5 
 
 		 153 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 149 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 		 172 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.6 
 
 		 131 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 137 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  36.15 
 
 		 134 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  43.7 
 
 		 132 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  43.7 
 
 		 132 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 148 aa  86.7  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.62 
 
 		 134 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 151 aa  86.3  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 148 aa  86.3  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 152 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 152 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 149 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 		 166 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 141 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  35.38 
 
 		 134 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  35.58 
 
 		 133 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  37.74 
 
 		 132 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  40.59 
 
 		 129 aa  84  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  38.68 
 
 		 130 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  37.74 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  35.83 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  39.5 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  39.22 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  39.22 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 		 150 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 133 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  41.38 
 
 		 136 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  36.13 
 
 		 136 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  36.79 
 
 		 132 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  40.78 
 
 		 129 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  40.32 
 
 		 132 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  33.98 
 
 		 132 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  37.82 
 
 		 142 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  32.35 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  40 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  37.74 
 
 		 130 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  36.13 
 
 		 137 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  33.6 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>