More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4229 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 150 aa  298  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  78.26 
 
 		 172 aa  233  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  78.99 
 
 		 151 aa  225  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  76.09 
 
 		 148 aa  213  5.9999999999999996e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  76.09 
 
 		 148 aa  213  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  75 
 
 		 155 aa  210  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  65.91 
 
 		 137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  64.66 
 
 		 151 aa  180  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  60.56 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  65.19 
 
 		 334 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  65.93 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  63.91 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  65.19 
 
 		 149 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  65.19 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  65.19 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  65.19 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  65.19 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  63.36 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  65.19 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  63.36 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  63.64 
 
 		 141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  62.22 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  64.39 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  60.61 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  64.12 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  62.22 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  62.22 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  62.22 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  60.43 
 
 		 152 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  60.43 
 
 		 152 aa  170  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  62.02 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  59.12 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  58.78 
 
 		 147 aa  156  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  54.2 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  47.59 
 
 		 314 aa  124  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  51.49 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  51.33 
 
 		 312 aa  116  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  48.33 
 
 		 325 aa  110  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  48.51 
 
 		 316 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  45.32 
 
 		 329 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  45.32 
 
 		 329 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  45.99 
 
 		 310 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.85 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.85 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.85 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  50 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  52.25 
 
 		 313 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  52.75 
 
 		 169 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  50.44 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  50.45 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  48.08 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  45.08 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  44.23 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  34.88 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  44.23 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  47.06 
 
 		 317 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  44.23 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  48.08 
 
 		 316 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  39.68 
 
 		 127 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.46 
 
 		 314 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.46 
 
 		 314 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.67 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  47.11 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  40.58 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  48.57 
 
 		 313 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  44 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.71 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  45.45 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  45.71 
 
 		 316 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  45.45 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  37.38 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  44.92 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.75 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  43.27 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  46.28 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  46.49 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  41.01 
 
 		 315 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  39.55 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  44.23 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  40.15 
 
 		 314 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  50.53 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  39.69 
 
 		 314 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  43.12 
 
 		 347 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  42.54 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  43.27 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  43.27 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  43.27 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 		 133 aa  83.6  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  41.73 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  43.31 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  47.17 
 
 		 315 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  39.37 
 
 		 132 aa  83.6  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  49 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  46.15 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>