More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0388 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  100 
 
 
138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  96.38 
 
 
138 aa  239  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  96.38 
 
 
138 aa  239  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  79.71 
 
 
138 aa  219  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  79.39 
 
 
137 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  79.39 
 
 
142 aa  213  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  77.04 
 
 
137 aa  213  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  77.86 
 
 
138 aa  211  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  77.86 
 
 
138 aa  211  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  77.1 
 
 
138 aa  210  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  76.92 
 
 
135 aa  209  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  76.52 
 
 
133 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  76.69 
 
 
133 aa  208  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  76.34 
 
 
135 aa  206  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  77.27 
 
 
132 aa  205  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  74.26 
 
 
137 aa  204  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  77.27 
 
 
132 aa  205  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  76.52 
 
 
133 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  77.27 
 
 
132 aa  204  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  77.34 
 
 
129 aa  204  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  76.52 
 
 
150 aa  204  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  82.61 
 
 
138 aa  203  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  84.62 
 
 
146 aa  202  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  75.76 
 
 
133 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  78.86 
 
 
136 aa  200  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  76.52 
 
 
144 aa  197  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  69.12 
 
 
136 aa  197  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  80.43 
 
 
138 aa  196  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  70.45 
 
 
132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  71.88 
 
 
128 aa  193  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  69.7 
 
 
132 aa  189  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  76.86 
 
 
135 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  67.65 
 
 
134 aa  185  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  69.23 
 
 
151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  65.65 
 
 
347 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  63.08 
 
 
334 aa  167  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  63.36 
 
 
135 aa  160  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  62.5 
 
 
137 aa  159  9e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  55.22 
 
 
138 aa  157  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  63.91 
 
 
142 aa  156  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  49.22 
 
 
153 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  46.97 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  47.2 
 
 
313 aa  102  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  50 
 
 
149 aa  102  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  45.76 
 
 
312 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 
139 aa  102  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.75 
 
 
310 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 
131 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  45 
 
 
329 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  45 
 
 
329 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  45.6 
 
 
315 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  38.17 
 
 
129 aa  99.4  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  44.35 
 
 
317 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.69 
 
 
131 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  45.6 
 
 
315 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  46.4 
 
 
138 aa  97.4  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  40.15 
 
 
329 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.06 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  40.16 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.06 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.06 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.66 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  42.4 
 
 
316 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  43.36 
 
 
306 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  40.17 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  43.22 
 
 
302 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 
138 aa  94  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  43.2 
 
 
314 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  43.2 
 
 
314 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  44.03 
 
 
142 aa  93.6  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  43.2 
 
 
314 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  43.33 
 
 
314 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  43.18 
 
 
320 aa  92.4  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  43.28 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  42.4 
 
 
314 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  39.84 
 
 
321 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  40.74 
 
 
400 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  43.61 
 
 
314 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  41.03 
 
 
317 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  42.42 
 
 
320 aa  90.9  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  47.29 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  38.28 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  35.88 
 
 
363 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  38.1 
 
 
132 aa  90.9  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.3 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  47.29 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
147 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.8 
 
 
131 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  39.55 
 
 
352 aa  90.5  8e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  41.94 
 
 
325 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 
128 aa  90.1  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  45.38 
 
 
383 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
135 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 
131 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.3 
 
 
135 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>