More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4940 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  100 
 
 
146 aa  286  8e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  82.96 
 
 
138 aa  209  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  76.34 
 
 
138 aa  207  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  76.34 
 
 
138 aa  207  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  74.81 
 
 
138 aa  205  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  70.14 
 
 
150 aa  204  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  75.76 
 
 
133 aa  202  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  73.68 
 
 
133 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  82.22 
 
 
138 aa  201  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  82.22 
 
 
138 aa  201  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  70.99 
 
 
142 aa  197  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  74.44 
 
 
138 aa  197  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  72.31 
 
 
137 aa  197  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  74.24 
 
 
137 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  74.24 
 
 
133 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  70.99 
 
 
137 aa  197  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  73.28 
 
 
135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  73.44 
 
 
129 aa  194  3e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  73.48 
 
 
133 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  71.97 
 
 
132 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  70.77 
 
 
135 aa  193  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  68.75 
 
 
144 aa  193  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  71.21 
 
 
132 aa  192  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  71.21 
 
 
132 aa  192  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  67.42 
 
 
132 aa  190  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  73.98 
 
 
136 aa  184  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  67.42 
 
 
132 aa  184  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  65.65 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  74.17 
 
 
135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  67.97 
 
 
128 aa  181  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  76.69 
 
 
138 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  76.3 
 
 
138 aa  180  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  68.22 
 
 
134 aa  178  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  65.65 
 
 
347 aa  174  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  65.38 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  63.08 
 
 
334 aa  169  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  55.15 
 
 
138 aa  157  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  61.6 
 
 
135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  59.17 
 
 
137 aa  152  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  59.85 
 
 
142 aa  147  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  48.41 
 
 
153 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  48.46 
 
 
318 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  45.6 
 
 
313 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  44.8 
 
 
315 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  44 
 
 
315 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.64 
 
 
131 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  39.57 
 
 
329 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.75 
 
 
310 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 
149 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  39.68 
 
 
129 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.6 
 
 
131 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  45.76 
 
 
312 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 
139 aa  99.4  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  42.4 
 
 
313 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  42.4 
 
 
314 aa  97.1  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 
128 aa  97.1  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  42.4 
 
 
314 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  41.73 
 
 
134 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  46.55 
 
 
329 aa  97.1  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 
128 aa  97.1  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 
128 aa  97.1  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 
137 aa  96.7  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  46.55 
 
 
329 aa  97.1  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  41.6 
 
 
316 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  42.28 
 
 
321 aa  96.3  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  42.4 
 
 
314 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  43.33 
 
 
306 aa  95.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  46.88 
 
 
320 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  44.92 
 
 
302 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  40.44 
 
 
400 aa  94.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  39.52 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  46.09 
 
 
320 aa  94.4  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  40.8 
 
 
314 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  34.96 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.71 
 
 
396 aa  92.8  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  39.2 
 
 
314 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  44.44 
 
 
317 aa  91.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  38.21 
 
 
363 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  43.05 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  44.06 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  38.06 
 
 
352 aa  91.3  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  37.9 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  43.06 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  39.2 
 
 
316 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  37.9 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  37.69 
 
 
129 aa  90.9  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  40 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.48 
 
 
132 aa  90.5  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.52 
 
 
131 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  36.8 
 
 
132 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  43.36 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  43.64 
 
 
130 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  43.36 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.52 
 
 
131 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  43.28 
 
 
319 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  43.36 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>