More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0465 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  100 
 
 
320 aa  638    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  97.19 
 
 
320 aa  596  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  69.87 
 
 
302 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  63.84 
 
 
318 aa  388  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.75 
 
 
321 aa  227  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  41.46 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  42.62 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  40.51 
 
 
315 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  40.51 
 
 
315 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.32 
 
 
314 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  40.19 
 
 
314 aa  203  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  40.32 
 
 
314 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.63 
 
 
316 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.32 
 
 
314 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  39.49 
 
 
314 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  41.85 
 
 
313 aa  198  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  39.17 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  39.37 
 
 
316 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  39.81 
 
 
310 aa  190  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  39.94 
 
 
319 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  42.39 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  41.45 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  38.61 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  40.58 
 
 
316 aa  172  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  37.7 
 
 
315 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  35.14 
 
 
325 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  34.6 
 
 
329 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  34.6 
 
 
329 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  33.67 
 
 
316 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  34.19 
 
 
317 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
352 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  33.74 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  38.38 
 
 
212 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.04 
 
 
199 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  42.19 
 
 
196 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  41 
 
 
209 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  41 
 
 
209 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  41 
 
 
209 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  41 
 
 
209 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  41 
 
 
209 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  41.67 
 
 
196 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  41.67 
 
 
196 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2246  thiamine monophosphate synthase  41.8 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0548714 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3747  thiamine monophosphate synthase  40.21 
 
 
194 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.907624  normal  0.127935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5573  thiamine monophosphate synthase  39.68 
 
 
194 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173749  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  40.74 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  40.74 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  40.74 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  36.22 
 
 
198 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  45.52 
 
 
137 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  45.11 
 
 
136 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
334 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  46.62 
 
 
144 aa  106  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  46.51 
 
 
142 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4895  thiamine monophosphate synthase  40.21 
 
 
194 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  46.34 
 
 
137 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  43.75 
 
 
134 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  44.62 
 
 
135 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 
133 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  44.88 
 
 
138 aa  103  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  44.88 
 
 
138 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  48.09 
 
 
347 aa  102  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  43.85 
 
 
132 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  46.51 
 
 
128 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
135 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  38.76 
 
 
132 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  38.76 
 
 
132 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  38.4 
 
 
130 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  38.17 
 
 
134 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  43.31 
 
 
138 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  39.2 
 
 
132 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 
138 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 
138 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 
135 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  38.76 
 
 
134 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  36.51 
 
 
129 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  38.58 
 
 
129 aa  99.8  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
135 aa  99.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  38.52 
 
 
130 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  43.85 
 
 
132 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  43.85 
 
 
132 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  44 
 
 
151 aa  99  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 
135 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
135 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 
135 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 
138 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  37.7 
 
 
130 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  45 
 
 
129 aa  98.6  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 
135 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 
150 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  43.9 
 
 
135 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 
138 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 
135 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 
133 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  37.7 
 
 
130 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.09 
 
 
138 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.09 
 
 
135 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
132 aa  96.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
137 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>