More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1106 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 139 aa  288  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  61.6 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  54.26 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  54.76 
 
 		 128 aa  141  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  47.06 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  47.06 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 138 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  48.28 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  45.38 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.38 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  45.69 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 141 aa  103  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  46.22 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  46.22 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  46.22 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  45.69 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 129 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 133 aa  98.6  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  44.74 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  43.22 
 
 		 313 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  46.02 
 
 		 138 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  44.54 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  43.9 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  43.9 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  47.27 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  40.17 
 
 		 318 aa  94.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  42.02 
 
 		 347 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  47.27 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 129 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  41.53 
 
 		 316 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  42.02 
 
 		 315 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  42.02 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.68 
 
 		 314 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  41.53 
 
 		 316 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  39.83 
 
 		 314 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.68 
 
 		 314 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  42.74 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  41.18 
 
 		 315 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.29 
 
 		 352 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  36.22 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  43.64 
 
 		 317 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  39.17 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40.68 
 
 		 314 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.46 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.26 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.26 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.26 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.26 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  39.26 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.06 
 
 		 363 aa  88.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.26 
 
 		 135 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 334 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  35.48 
 
 		 352 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.26 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  37.9 
 
 		 132 aa  88.2  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  37.9 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  38.98 
 
 		 313 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  38.98 
 
 		 314 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  38.52 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  38.71 
 
 		 134 aa  87  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  36.13 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  34.35 
 
 		 384 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  36.89 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  44.14 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.5 
 
 		 360 aa  85.9  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>