More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1931 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  63.08 
 
 		 154 aa  174  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  62.12 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  59.02 
 
 		 141 aa  164  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  61.67 
 
 		 136 aa  164  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  56.67 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  54.84 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  49.14 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  39.39 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  40.16 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  40 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.31 
 
 		 360 aa  90.9  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  34.33 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  45.08 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  42.62 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  44.26 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  43.9 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  39.06 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.67 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  35.43 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  38.71 
 
 		 316 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  38.71 
 
 		 316 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  41.73 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  37.88 
 
 		 318 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  37.88 
 
 		 320 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  37.4 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  43.44 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.21 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  37.88 
 
 		 320 aa  84  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  35.94 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  37.9 
 
 		 314 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  43.44 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  38.71 
 
 		 138 aa  83.6  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  38.71 
 
 		 138 aa  83.6  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  38.71 
 
 		 314 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  40.16 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  38.71 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  37.3 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  37.3 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  37.9 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  40.65 
 
 		 322 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  42.62 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  42.62 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  38.89 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.34 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  38.71 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  35.16 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  39.34 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.34 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  37.1 
 
 		 313 aa  78.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  35.16 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  40.16 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  40.46 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  31.97 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  39.83 
 
 		 302 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  36 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  42.61 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  35.77 
 
 		 316 aa  77  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>