More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0673 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  100 
 
 
360 aa  738    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  63.17 
 
 
363 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  64.43 
 
 
386 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  65.51 
 
 
352 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  65.04 
 
 
352 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  55.07 
 
 
396 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  52.89 
 
 
400 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  55.73 
 
 
352 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  49.44 
 
 
383 aa  358  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  45.11 
 
 
384 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  45.23 
 
 
399 aa  338  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.57 
 
 
384 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  47.26 
 
 
352 aa  311  9e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  44.41 
 
 
388 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  42.58 
 
 
373 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  40.35 
 
 
360 aa  280  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  42.55 
 
 
354 aa  272  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  42.55 
 
 
354 aa  272  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  41.28 
 
 
360 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  38.53 
 
 
366 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  41.67 
 
 
434 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.71 
 
 
368 aa  259  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  39.05 
 
 
374 aa  256  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  39.94 
 
 
369 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 
368 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  37.4 
 
 
435 aa  255  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.03 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1123  A/G-specific adenine glycosylase  38.14 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000383287  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  39.36 
 
 
383 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 
368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.67 
 
 
350 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3176  A/G-specific adenine glycosylase  40.29 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  41.08 
 
 
370 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  38.4 
 
 
396 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  40.79 
 
 
368 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  41.36 
 
 
350 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  36.83 
 
 
366 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  41.31 
 
 
368 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  41.31 
 
 
368 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  41.31 
 
 
368 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  41.31 
 
 
368 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  41.31 
 
 
368 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  41.31 
 
 
368 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  41.31 
 
 
368 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  45 
 
 
365 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.06 
 
 
368 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4128  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.89 
 
 
375 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  36.18 
 
 
365 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000608246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  35.9 
 
 
365 aa  246  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  36.47 
 
 
365 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000440987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3366  adenine DNA glycosylase  44.67 
 
 
352 aa  246  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0209119 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  36.18 
 
 
365 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1319  A/G-specific adenine glycosylase  42.63 
 
 
382 aa  246  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.565336  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  36.68 
 
 
364 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  36.18 
 
 
365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  36.18 
 
 
365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45 
 
 
372 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  43.3 
 
 
419 aa  245  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  36.47 
 
 
365 aa  245  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000193741  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  41 
 
 
354 aa  245  9e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.67 
 
 
372 aa  245  9e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000236828  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.67 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000011452  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  44.48 
 
 
383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  35.9 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000370724  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2945  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  45.57 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  43.69 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  35.04 
 
 
365 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  43.3 
 
 
371 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02670  putative A/G-specific adenine glycosylase  40.26 
 
 
351 aa  243  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  42.33 
 
 
372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  0.00000764149 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2698  A/G-specific adenine glycosylase  41.9 
 
 
357 aa  242  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.285763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  35.61 
 
 
365 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000761286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  42.03 
 
 
374 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  38.33 
 
 
355 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0937  A/G-specific adenine glycosylase  39.19 
 
 
349 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  40.77 
 
 
382 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  40.24 
 
 
350 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2484  A/G-specific adenine glycosylase  40.64 
 
 
351 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.054376  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0590  A/G-specific adenine glycosylase  39.12 
 
 
353 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.123434  decreased coverage  0.000793491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0765  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.5 
 
 
374 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  42.86 
 
 
368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  37.75 
 
 
355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.91 
 
 
361 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01430  A/G-specific adenine glycosylase  38.9 
 
 
357 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.71 
 
 
345 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1092  A/G-specific adenine glycosylase  38.97 
 
 
388 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3274  adenine DNA glycosylase  43.89 
 
 
350 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4265  adenine DNA glycosylase  44.67 
 
 
350 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3104  adenine DNA glycosylase  44 
 
 
350 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400976 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  37.39 
 
 
381 aa  239  6.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  41.06 
 
 
353 aa  239  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0234  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  46.77 
 
 
365 aa  238  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3307  adenine DNA glycosylase  44.67 
 
 
360 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02791  adenine DNA glycosylase  44.67 
 
 
350 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0610871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0734  A/G-specific adenine glycosylase  44.67 
 
 
350 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0753  adenine DNA glycosylase  44.67 
 
 
350 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852915  normal  0.0133097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3122  adenine DNA glycosylase  44.26 
 
 
360 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02754  hypothetical protein  44.67 
 
 
350 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0736099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3358  adenine DNA glycosylase  43.56 
 
 
350 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.173815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>