More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1547 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  100 
 
 
334 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  49.07 
 
 
347 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  65.19 
 
 
137 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  64.93 
 
 
137 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  63.7 
 
 
142 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  64.18 
 
 
135 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  65.38 
 
 
132 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  65.38 
 
 
132 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  67.69 
 
 
144 aa  180  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  62.22 
 
 
136 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  67.18 
 
 
151 aa  179  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  62.41 
 
 
134 aa  179  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  66.15 
 
 
132 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  63.85 
 
 
132 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  65.38 
 
 
133 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  64.39 
 
 
135 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  64.62 
 
 
132 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  63.08 
 
 
150 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  62.31 
 
 
138 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 
129 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  64.06 
 
 
128 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  66.94 
 
 
136 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  62.31 
 
 
133 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  60.77 
 
 
138 aa  169  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  60.77 
 
 
138 aa  169  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 
138 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  62.31 
 
 
133 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 
133 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  60.77 
 
 
137 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  63.33 
 
 
135 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  59.85 
 
 
138 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  67.52 
 
 
138 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 
138 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  62.5 
 
 
138 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  55.83 
 
 
137 aa  154  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  63.25 
 
 
146 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  63.25 
 
 
138 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  63.25 
 
 
138 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  53.79 
 
 
142 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  52.71 
 
 
135 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 
153 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  50 
 
 
318 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  47.93 
 
 
302 aa  102  8e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  44.44 
 
 
314 aa  102  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  46.88 
 
 
320 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  38.3 
 
 
329 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  46.09 
 
 
320 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.67 
 
 
321 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  44.26 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  45.08 
 
 
313 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  47.75 
 
 
149 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  40.26 
 
 
383 aa  97.1  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  41.73 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  45.08 
 
 
315 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 
174 aa  95.9  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  44.44 
 
 
315 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  34.31 
 
 
363 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.06 
 
 
131 aa  93.2  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  43.33 
 
 
312 aa  93.2  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  34.81 
 
 
386 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.9 
 
 
310 aa  92.4  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  36 
 
 
132 aa  92.4  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  34.38 
 
 
129 aa  92.4  9e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
138 aa  92.4  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  41.26 
 
 
147 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  41.13 
 
 
306 aa  92  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.16 
 
 
316 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  37.9 
 
 
134 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  46.3 
 
 
329 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  46.3 
 
 
329 aa  92  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  36 
 
 
132 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
176 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  36.8 
 
 
134 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
137 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  40.48 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  35.2 
 
 
132 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.06 
 
 
131 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  36.51 
 
 
131 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  43.65 
 
 
316 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  38.52 
 
 
130 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  33.33 
 
 
142 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  40.98 
 
 
314 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
139 aa  89.7  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  38.52 
 
 
130 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  39.83 
 
 
315 aa  89.7  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  36.07 
 
 
131 aa  89.4  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  38.52 
 
 
130 aa  89.4  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  34.4 
 
 
133 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.38 
 
 
138 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
138 aa  88.6  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.38 
 
 
138 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  35.2 
 
 
130 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  46.15 
 
 
138 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  39.34 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  42.45 
 
 
141 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  37.29 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  41.67 
 
 
142 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.48 
 
 
132 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.13 
 
 
135 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
128 aa  87.4  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>