More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1643 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
176 aa  364  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  46.95 
 
 
184 aa  141  6e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  45.73 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  38.69 
 
 
184 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07104  acetyltransferase  41.38 
 
 
177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  36.36 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  35.93 
 
 
181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  37.2 
 
 
216 aa  111  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
231 aa  111  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  37.2 
 
 
216 aa  110  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  35.33 
 
 
182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  35.33 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  38.1 
 
 
189 aa  106  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
173 aa  105  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
174 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
178 aa  103  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  40.49 
 
 
177 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
198 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
216 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
218 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 
202 aa  98.2  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  33.94 
 
 
218 aa  97.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
213 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
197 aa  97.8  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  33.73 
 
 
183 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0311818 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  33.74 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
198 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  35.47 
 
 
214 aa  94.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
189 aa  91.3  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
221 aa  90.5  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
199 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  32.89 
 
 
187 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
199 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1148  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  32.32 
 
 
210 aa  87  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 
199 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
199 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  33.53 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
218 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
198 aa  85.5  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6345  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.881821  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.750296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5747  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.020842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
198 aa  80.9  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  32.57 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  25.75 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  32.92 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  32.07 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  31.95 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  33.51 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211341  normal  0.620155 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1854  GCN5-related N-acetyltransferase  37.75 
 
 
197 aa  77  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.291237 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1833  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.98 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  30.98 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
195 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  38.83 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.83 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  31.97 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5893  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  33.54 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2167  hypothetical protein  32.4 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.670672  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0271  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2075  hypothetical protein  32.4 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
181 aa  72  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  32.68 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  32.68 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0305  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.68 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  32.03 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2153  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5548  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  24.26 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>