More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3008 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 200 aa  413  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  70.11 
 
 		 195 aa  268  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  70.86 
 
 		 182 aa  255  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  65.97 
 
 		 198 aa  252  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  35.8 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  35.8 
 
 		 216 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 		 174 aa  95.5  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 		 231 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  38.32 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  37.82 
 
 		 177 aa  91.3  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  37.25 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  35.15 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  34.32 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 		 198 aa  81.6  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  32.79 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  35.95 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  35.47 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  31.14 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  32.24 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  31.74 
 
 		 347 aa  75.5  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  28.29 
 
 		 177 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 		 169 aa  74.3  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0962  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.397264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  28.99 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0311818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  29.03 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2014  hypothetical protein  34.16 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1418  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1465  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0333555 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  29.03 
 
 		 181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  28.57 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  30.41 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  32.14 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1731  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  29.82 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0443  acetyltransferase  30.87 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0378222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  26.53 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1358  acetyltransferase  27.85 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  32.54 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1120  hypothetical protein  30.87 
 
 		 173 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.495125 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0442  acetyltransferase  33.77 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00386351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2075  hypothetical protein  29.03 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2167  hypothetical protein  29.03 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.670672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5747  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.020842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0342  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  28.86 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1840  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1513  acetyltransferase  28.48 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0154718  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3559  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3197  acetyltransferase  26.52 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0555385  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3258  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  26.04 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3472  acetyltransferase  25.97 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>