More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3007 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 221 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  78.18 
 
 		 218 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  76.92 
 
 		 218 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  74.42 
 
 		 210 aa  337  8e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  56.99 
 
 		 216 aa  234  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  56.45 
 
 		 216 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  55.91 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  54.69 
 
 		 197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  41.71 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  40.41 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  41.71 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  39.57 
 
 		 199 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  37.95 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  38.5 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  38.71 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 		 174 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  36.96 
 
 		 184 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  35.08 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  34.41 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 		 185 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  33.51 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 176 aa  92  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 		 176 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  32.8 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  33.33 
 
 		 195 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  35.39 
 
 		 183 aa  85.5  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07104  acetyltransferase  32.7 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  27.33 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  26.11 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  32.47 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  30.81 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  24.56 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0271  GCN5-related N-acetyltransferase  26.7 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0962  hypothetical protein  36.99 
 
 		 157 aa  74.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.397264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  30.27 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  32.43 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  29.44 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  28.48 
 
 		 163 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 		 179 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0320  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.810608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1120  hypothetical protein  31.85 
 
 		 173 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  26.42 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0457106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0298  hypothetical protein  36.56 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0311  acetyltransferase related protein  29.45 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  27.75 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5747  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.020842 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  26.97 
 
 		 168 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 		 190 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.33 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  30.94 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 		 178 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 		 169 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  30.92 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3398  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.52 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0084357  normal  0.312955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  27.67 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  27.23 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2178  acetyltransferase, GNAT family  44.44 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.810556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  26.49 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  27.67 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0700  GCN5-related N-acetyltransferase  23.03 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503047  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1833  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.06 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  26.49 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  26.49 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  23.53 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  26.84 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  26.74 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2860  acetyltransferase, GNAT family  24.68 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>