More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4763 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  99.44 
 
 		 189 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  92.13 
 
 		 190 aa  344  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  93.22 
 
 		 189 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  70.06 
 
 		 189 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  70.45 
 
 		 189 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  68.93 
 
 		 189 aa  262  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  60.12 
 
 		 186 aa  197  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  53.45 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  52.91 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  54.65 
 
 		 187 aa  181  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  48.26 
 
 		 178 aa  177  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  52.3 
 
 		 196 aa  174  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  51.72 
 
 		 196 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  51.72 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  47.95 
 
 		 195 aa  168  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  50.58 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  54.12 
 
 		 190 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  48.26 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  43.6 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  46.51 
 
 		 189 aa  154  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  47.7 
 
 		 186 aa  154  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  43.6 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  47.31 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  48.5 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  47.4 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  45.56 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  43.6 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  44.63 
 
 		 184 aa  147  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  43.98 
 
 		 181 aa  147  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 		 194 aa  141  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  42.51 
 
 		 182 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  43.79 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  43.1 
 
 		 188 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  42.51 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  43.71 
 
 		 188 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4532  GCN5-related N-acetyltransferase  47.06 
 
 		 296 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 		 180 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 		 189 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  44.25 
 
 		 318 aa  124  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  41.9 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 191 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  45.89 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  42.46 
 
 		 285 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.338216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  40.12 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  37.87 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0788  acetyltransferase  45.69 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  38.92 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  36.57 
 
 		 207 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  34.71 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  36.26 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.08 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00124051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 		 177 aa  78.2  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  31.94 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3269  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  28.77 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.53 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  28.96 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08539  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03650)  34.52 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  29.44 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  30.92 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7126  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  29.8 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0983  hypothetical protein  28.73 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  26.16 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  25.56 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  32.78 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  28.25 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.215241  normal  0.0203096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>