More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2792 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  100 
 
 		 201 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3519  acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein  49.64 
 
 		 185 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.420967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  39.49 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 		 165 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 170 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 		 165 aa  104  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 		 165 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  35.42 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3536  acetyltransferase  34.81 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3228  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 		 167 aa  99.8  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3255  GCN5-related N-acetyltransferase  34.93 
 
 		 171 aa  99  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 		 174 aa  98.6  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  36.11 
 
 		 166 aa  98.2  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 		 174 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 165 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 165 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  35.15 
 
 		 175 aa  95.9  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 165 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 		 178 aa  95.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1733  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.91 
 
 		 167 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3517  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.91 
 
 		 167 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 		 177 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1460  acetyltransferase  32.12 
 
 		 169 aa  93.2  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.176845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  35.81 
 
 		 175 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  32.95 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 167 aa  88.2  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 		 165 aa  88.2  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 		 183 aa  88.2  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 165 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2707  acetyltransferase  32 
 
 		 171 aa  87.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  31.41 
 
 		 189 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 		 185 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 		 176 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  32.7 
 
 		 175 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13328  acetyltransferase, GNAT family protein  36.24 
 
 		 169 aa  87  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  32.7 
 
 		 175 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  32.26 
 
 		 396 aa  86.7  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  34.46 
 
 		 175 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 170 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.630016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.08 
 
 		 175 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  30.67 
 
 		 178 aa  85.5  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2860  acetyltransferase, GNAT family  31.55 
 
 		 178 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.08 
 
 		 175 aa  85.1  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  36.49 
 
 		 182 aa  85.1  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 		 187 aa  85.1  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 		 167 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 167 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.905398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 		 167 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 		 190 aa  84.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 		 165 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  35.81 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4577  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 		 166 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000162939  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1507  putative acetyltransferase  30.18 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  30.82 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  35.1 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  32.68 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  29.51 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  33.79 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3538  acetyltransferase, gnat family  37.4 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47154  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  33.77 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  32.89 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  34.13 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  32.21 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2577  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.230542  normal  0.273623 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0445  hypothetical protein  30.38 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  29.94 
 
 		 601 aa  79  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  31.69 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>