More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1131 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
190 aa  388  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  78.36 
 
 
178 aa  273  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  69.4 
 
 
192 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  45.9 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  44.32 
 
 
194 aa  151  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  38.5 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  39.16 
 
 
180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  37.14 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
181 aa  104  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
185 aa  99  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  36.67 
 
 
178 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  32.57 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
183 aa  98.6  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
195 aa  97.8  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1431  acetyltransferase  40.28 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  35.42 
 
 
185 aa  95.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  33.78 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  31.55 
 
 
194 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  33.79 
 
 
180 aa  94  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
170 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
190 aa  90.9  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  31.43 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  30.92 
 
 
186 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  35.86 
 
 
192 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
176 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
168 aa  88.6  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  36.81 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  26.26 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  35.17 
 
 
195 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0177  acetyltransferase  36.6 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0788  acetyltransferase  36.43 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  30.23 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2713  putative acetyltransferase  36.6 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.699108  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  29.53 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  33.12 
 
 
192 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1052  acetyltransferase  36.6 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  31.17 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  35.79 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0755  acetyltransferase  33.56 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  32.4 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  30.61 
 
 
196 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  32.28 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  27.27 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  28.86 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  29.53 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.69 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3269  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0352  acetyltransferase  32 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  34 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1419  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  34.19 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0753  acetyltransferase  31.72 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  31.49 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  29.83 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2712  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.757846  normal  0.0335255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1051  hypothetical protein  34.19 
 
 
176 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  30.87 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  29.25 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  25.86 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0249063  normal  0.199157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  35.03 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1717  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
173 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  31.64 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>