More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2226 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  41.28 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  41.62 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 
194 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
190 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  40.76 
 
 
181 aa  111  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
185 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
192 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
180 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
177 aa  92.8  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 
178 aa  92  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
187 aa  92  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  35.03 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0249063  normal  0.199157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  31.52 
 
 
189 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
171 aa  85.1  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.988966  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  39.35 
 
 
178 aa  85.1  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  39.16 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
171 aa  84.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7056  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  37.32 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0346868 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  32.32 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4498  acetyltransferase, GNAT family  30.41 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  32.77 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.410828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4445  acetyltransferase, GNAT family  30.41 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  30.41 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  30.43 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.89 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  30.41 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4109  acetyltransferase  30.41 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4593  acetyltransferase  30.41 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6557  GCN5-related N-acetyltransferase  37.09 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  34.76 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0752  acetyltransferase, GNAT family  29.89 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7126  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
177 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158262  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  32.37 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2713  putative acetyltransferase  35.26 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.699108  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6271  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  29.89 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1052  acetyltransferase  34.62 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0037  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  35.15 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35.19 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4261  acetyltransferase  30.41 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  27.81 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2293  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.560529  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0755  acetyltransferase  36.81 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  31.49 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  28.96 
 
 
194 aa  73.9  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0350  hypothetical protein  32.19 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1431  acetyltransferase  35.17 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  34.43 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0177  acetyltransferase  32.9 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  33.11 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  36.99 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3081  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
168 aa  72  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  33.11 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.1 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  31.46 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2526  acetyltransferase  36.36 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0308395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0317  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  31.14 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0903  putative acetyltransferase  32.08 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  30.94 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  31.87 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  31.97 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  32.24 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>