241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6557 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6557  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 175 aa  353  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6271  GCN5-related N-acetyltransferase  97.14 
 
 		 184 aa  345  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7056  GCN5-related N-acetyltransferase  87.93 
 
 		 179 aa  318  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6159  GCN5-related N-acetyltransferase  87.93 
 
 		 188 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.887134  normal  0.0717303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1278  GCN5-related N-acetyltransferase  87.36 
 
 		 188 aa  291  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6553  GCN5-related N-acetyltransferase  87.36 
 
 		 188 aa  291  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1388  GCN5-related N-acetyltransferase  54.27 
 
 		 176 aa  168  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  47.06 
 
 		 178 aa  168  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  50.65 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  43.6 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  48.21 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  45.61 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  46.75 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7126  GCN5-related N-acetyltransferase  44.59 
 
 		 177 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  45.56 
 
 		 171 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  44.38 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2397  acetyltransferase  47.68 
 
 		 336 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1193  acetyltransferase  47.68 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1115  acetyltransferase  43.79 
 
 		 207 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1758  acetyltransferase  47.02 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0671  acetyltransferase  43.2 
 
 		 204 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0794  acetyltransferase  43.2 
 
 		 204 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  42.38 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 180 aa  127  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  39.2 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0249063  normal  0.199157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0037  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 		 207 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0753  acetyltransferase  36.67 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  37.09 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  30.99 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  32.24 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  28.29 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0346868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2526  acetyltransferase  39.74 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0308395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  30.07 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.09 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3269  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1052  acetyltransferase  32.67 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  32.45 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2713  putative acetyltransferase  32.67 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.699108  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0350  hypothetical protein  29.33 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4445  acetyltransferase, GNAT family  28.09 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4593  acetyltransferase  28.09 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  28.09 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  28.09 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4109  acetyltransferase  28.09 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  28.29 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  25.79 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0177  acetyltransferase  29.33 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0752  acetyltransferase, GNAT family  27.53 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1031  acetyltransferase  38.46 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462594  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1272  acetyltransferase  38.46 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  30 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1960  acetyltransferase  38.46 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00531041  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1808  acetyltransferase  38.46 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4498  acetyltransferase, GNAT family  27.84 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0135  acetyltransferase  38.46 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1787  acetyltransferase  38.46 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.600218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3081  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  28.86 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 		 179 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1760  acetyltransferase  38.31 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.319622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  30.97 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  30.33 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  32.9 
 
 		 195 aa  51.6  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  33.33 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 		 167 aa  51.6  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4261  acetyltransferase  28.09 
 
 		 167 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4127  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 		 174 aa  51.2  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>