More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4294 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  100 
 
 
189 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  91.53 
 
 
189 aa  359  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  79.14 
 
 
189 aa  307  6.999999999999999e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  70.9 
 
 
189 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  69.68 
 
 
189 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  69.15 
 
 
190 aa  275  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  68.93 
 
 
178 aa  262  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  59.12 
 
 
186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  54.64 
 
 
187 aa  200  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  52.22 
 
 
192 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  54.1 
 
 
190 aa  187  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  50.85 
 
 
178 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  52.22 
 
 
188 aa  184  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  51.37 
 
 
195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  50 
 
 
196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  50.82 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  49.44 
 
 
196 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  48.09 
 
 
192 aa  174  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  48.65 
 
 
181 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  45.56 
 
 
188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  46.28 
 
 
186 aa  170  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  49.44 
 
 
184 aa  168  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  46.41 
 
 
190 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
184 aa  164  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  49.43 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  49.7 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  47.78 
 
 
186 aa  161  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  43.89 
 
 
189 aa  161  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  46.11 
 
 
183 aa  158  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  44.57 
 
 
181 aa  157  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
187 aa  156  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  47.13 
 
 
177 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  45.56 
 
 
204 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  45.98 
 
 
182 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  44.51 
 
 
188 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  45.4 
 
 
182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  43.65 
 
 
194 aa  151  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  45.03 
 
 
188 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  46.24 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4532  GCN5-related N-acetyltransferase  49.42 
 
 
296 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  42.13 
 
 
180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  45.88 
 
 
318 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 
191 aa  131  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  41.04 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  41.04 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  41.04 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  47.92 
 
 
146 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  42.05 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  40.11 
 
 
182 aa  125  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0788  acetyltransferase  48.78 
 
 
172 aa  122  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
185 aa  121  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  37.71 
 
 
170 aa  111  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  41.62 
 
 
285 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.338216  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
207 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  38.36 
 
 
182 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  31.41 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
174 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  31.32 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  31.32 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  31.32 
 
 
180 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  31.32 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  31.32 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.32 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  31.32 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.77 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.87 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  30.14 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.410828  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  28.16 
 
 
171 aa  75.1  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  30.14 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  34 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
170 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  30.13 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  28.96 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  28.42 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
165 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>