More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6108 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
176 aa  348  2e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.410828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29330  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  45.39 
 
 
174 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4127  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5650  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1005  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
183 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  37.09 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  27.27 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  31.97 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  31.54 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  27.52 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0220  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0394642  hitchhiker  0.00447894 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  25.45 
 
 
396 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  28.39 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0963  acetyltransferase  33.33 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.17018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  34 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.215241  normal  0.0203096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  33.14 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  32 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  31.69 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  26 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7126  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158262  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4260  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
193 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  34.27 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  35.26 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  26.49 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  27.92 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  25.33 
 
 
175 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.97 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2706  hypothetical protein  22.22 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
165 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2763  hypothetical protein  22.22 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  31.97 
 
 
178 aa  61.6  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  26.62 
 
 
175 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  26.62 
 
 
175 aa  61.6  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  29.61 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
174 aa  61.2  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
165 aa  60.8  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
176 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6386  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  28.05 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2358  acetyltransferase  26.8 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2534  acetyltransferase  26.8 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
168 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2873  YnaD  28.19 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2860  acetyltransferase, GNAT family  25.17 
 
 
178 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
175 aa  57.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
188 aa  57.4  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0249063  normal  0.199157 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  30.34 
 
 
176 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  31.61 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3284  acetyltransferase, GNAT family  26 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2474  acetyltransferase, GNAT family  27.52 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  26.35 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  26.35 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.35 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.35 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  26.35 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  26.35 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1789  GCN5-related protein N-acetyltransferase  31.97 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal  0.254544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
194 aa  55.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  26.85 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1460  acetyltransferase  29.17 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.176845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>