97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0220 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0220  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
183 aa  361  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0394642  hitchhiker  0.00447894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  48.47 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.410828  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  30 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
165 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
347 aa  61.6  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  30.61 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
166 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5650  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  26.67 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
170 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1005  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
183 aa  54.7  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
173 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
174 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
183 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4260  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
193 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
168 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
192 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
285 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.338216  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
204 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  27.78 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  24.32 
 
 
175 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1981  protein of unknown function DUF523  32.92 
 
 
354 aa  48.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3255  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
171 aa  47.8  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
177 aa  47.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
207 aa  47.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  28.57 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1193  acetyltransferase  33.62 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  33.55 
 
 
187 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
175 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
184 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  24.16 
 
 
175 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1115  acetyltransferase  33.62 
 
 
207 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  22.82 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
199 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0794  acetyltransferase  33.62 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  30.83 
 
 
318 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0671  acetyltransferase  33.62 
 
 
204 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1388  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1758  acetyltransferase  33.62 
 
 
225 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
176 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2397  acetyltransferase  33.62 
 
 
336 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
190 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
196 aa  45.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  36.99 
 
 
195 aa  44.7  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.22 
 
 
170 aa  44.7  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
174 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  28.66 
 
 
192 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3937  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0592305  normal  0.264283 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4555  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  29.49 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  25.49 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 
177 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  26.58 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  28.86 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.84 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4127  GCN5-related N-acetyltransferase  23.57 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
185 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  24.18 
 
 
195 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0037  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
181 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  21.62 
 
 
175 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  22.97 
 
 
396 aa  42.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4647  hypothetical protein  27.71 
 
 
187 aa  42  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00553869  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  24.43 
 
 
189 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  27.63 
 
 
181 aa  42  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.3 
 
 
175 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
200 aa  41.6  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0478  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 
172 aa  41.6  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1460  acetyltransferase  30.99 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.176845  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  25.33 
 
 
188 aa  41.6  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
185 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
189 aa  40.8  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>