More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3255 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3255  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
171 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  74.1 
 
 
166 aa  267  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  72.89 
 
 
166 aa  258  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  68.07 
 
 
166 aa  241  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  59.39 
 
 
165 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  59.39 
 
 
165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  58.79 
 
 
165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  62.87 
 
 
167 aa  209  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  59.64 
 
 
174 aa  206  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  56.97 
 
 
170 aa  204  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  56.97 
 
 
165 aa  204  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  56.97 
 
 
165 aa  203  8e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  55.76 
 
 
165 aa  203  9e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  56.97 
 
 
165 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  56.36 
 
 
165 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
175 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  35.09 
 
 
174 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  34.93 
 
 
201 aa  99  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
174 aa  98.2  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
181 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
176 aa  94.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
178 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2707  acetyltransferase  34.25 
 
 
171 aa  87  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  30.64 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13328  acetyltransferase, GNAT family protein  33.8 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248311  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1460  acetyltransferase  31.51 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.176845  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
167 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.905398  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  31.33 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.33 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  31.33 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  31.33 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  30.67 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3536  acetyltransferase  29.93 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  29.94 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  30.67 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  31.33 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  31.41 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1507  putative acetyltransferase  30.46 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  28.74 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2744  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  32.64 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
195 aa  70.9  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  31.29 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.630016 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  28.12 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  27.67 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1733  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3519  acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein  32.67 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.420967  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  32.03 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2577  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.230542  normal  0.273623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  29.63 
 
 
185 aa  68.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
196 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  29.68 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  30.14 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  29.93 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
170 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0445  GCN5-related N-acetyltransferase  30.5 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.159299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  28.78 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>