More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2707 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2707  acetyltransferase  100 
 
 
171 aa  349  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  92.68 
 
 
165 aa  315  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  92.68 
 
 
165 aa  313  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  92.07 
 
 
165 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  83.54 
 
 
170 aa  279  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  77.71 
 
 
167 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  77.71 
 
 
167 aa  266  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  78.66 
 
 
165 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  76.51 
 
 
167 aa  261  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.905398  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2744  GCN5-related N-acetyltransferase  48.52 
 
 
175 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  54.3 
 
 
168 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1743  GCN5-related N-acetyltransferase  50.33 
 
 
167 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3228  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
167 aa  156  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1733  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  50 
 
 
167 aa  153  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  47.83 
 
 
170 aa  151  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.630016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3517  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  48.8 
 
 
167 aa  150  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3536  acetyltransferase  46.99 
 
 
167 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1507  putative acetyltransferase  51.37 
 
 
167 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1460  acetyltransferase  49.09 
 
 
169 aa  144  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.176845  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2577  GCN5-related N-acetyltransferase  47.74 
 
 
169 aa  144  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.230542  normal  0.273623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0445  GCN5-related N-acetyltransferase  42.24 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.159299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4577  GCN5-related N-acetyltransferase  43.37 
 
 
166 aa  128  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000162939  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 
171 aa  127  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3538  acetyltransferase, gnat family  48.8 
 
 
125 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47154  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05693  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.82 
 
 
169 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000080  putative acetyltransferase  41.21 
 
 
169 aa  117  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13328  acetyltransferase, GNAT family protein  38.18 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248311  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0051  acetyltransferase  37.95 
 
 
175 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal  0.472736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  36.6 
 
 
174 aa  97.8  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03674  Acetyltransferase, including N-acetylase of ribosomal protein  38.16 
 
 
174 aa  96.7  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
174 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  35.95 
 
 
178 aa  91.3  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
165 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
165 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  32 
 
 
201 aa  87.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3255  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
171 aa  87  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  36.24 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
170 aa  84.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
166 aa  84.7  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  35.37 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
190 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  34.76 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.76 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  34.76 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  34.76 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.5 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  34.15 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  34.57 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  34.76 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4109  acetyltransferase  31.87 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  27.63 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  31.87 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  31.25 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.54 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4498  acetyltransferase, GNAT family  31.25 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4445  acetyltransferase, GNAT family  31.25 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4593  acetyltransferase  31.25 
 
 
168 aa  79  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0752  acetyltransferase, GNAT family  32.43 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4261  acetyltransferase  30.19 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  29.03 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3081  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3519  acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein  36.94 
 
 
185 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.420967  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  30.41 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  29.73 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  30.32 
 
 
601 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  29.73 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  28.39 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.73 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.41 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02198  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2860  acetyltransferase, GNAT family  29.41 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.11 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1005  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2892  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.166818  hitchhiker  0.00354193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  35.06 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  43.16 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.21 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  32.68 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  26 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>